Los cerdos son una especie social y establecen jerarquías para un mejor uso de los recursos y para reducir conflictos. Sin embargo, en la producción porcina, las oportunidades de crecimiento pueden diferir entre los animales dominantes y los subordinados. En el presente estudio, se probó un sistema para realizar una prueba de dominancia versus subordinación en cerdos en crecimiento para investigar cómo la jerarquía afecta el comportamiento alimentario, el crecimiento y la microbiota intestinal evaluada en las heces. Se utilizaron sesenta y cuatro animales alojados en ocho corrales diferentes, con cuatro machos castrados y cuatro hembras en cada uno, pesando 18 kg al llegar y mantenidos durante todo el período de crecimiento, hasta 140 kg. Se obtuvieron tres muestras de heces de los animales directamente del ano para evitar la contaminación de las heces 58, 100 y 133 días después del inicio del estudio para investigar la composición de la microbiota. Los animales dominantes tuvieron mayores ganancias durante el período de crecimiento que los subordinados. Además, realizaron más visitas al comedero a lo largo del día. Se observaron patrones de abundancia diferencial en cinco géneros bacterianos, siendo más abundantes en animales dominantes y sobrerepresentados en los subordinados. Este biomarcador microbiano clasificó con precisión los grupos de muestras dominantes versus subordinadas con un AUC de 0.92.