La enfermedad de Marek es causada por el virus de la enfermedad de Marek (MDV). Este patógeno infecta diversas especies de aves, lo que resulta en una variedad de manifestaciones clínicas. El gen, que es crucial para la oncogénesis, ha sido estudiado extensamente, pero las investigaciones moleculares del MDV en aves no comerciales de América del Sur son limitadas. Este estudio detectó MDV en aves de traspatio y ornamentales de Brasil y Perú y caracterizó el gen. Se confirmó la presencia de MDV en los siete brotes examinados. Se detectaron tres isoformas de (S-, , y L-) y de dos a siete regiones de repetición de prolina (PRRs) entre las cepas secuenciadas. A nivel de aminoácidos, se identificaron perfiles genéticos con potencial de virulencia baja y alta. El análisis filogenético agrupó las secuencias en tres clústeres distintos. El análisis de presión de selección reveló 18 y 15 codones bajo selección positiva y negativa, respectivamente. Los resultados demuestran una diversidad significativa de MDV en las aves estudiadas, con potenciales de virulencia tanto altos como bajos. Este estudio destaca la importancia de monitorear y caracterizar el MDV circulante en aves de traspatio y ornamentales, ya que pueden actuar como reservorios para futuros brotes epidemiológicos.