La mayoría de los anuros deben pasar por metamorfosis para adaptarse a la vida terrestre. Este proceso mejora la capacidad de respiración aérea de los pulmones para hacer frente al cambio en el medio de oxígeno de agua a aire. Revelar la construcción estructural y los interruptores moleculares de la organogénesis pulmonar es esencial para comprender la realización de la función de respiración aérea. En este estudio, se realizaron histología y transcriptómica en combinación para explorar estos temas en los pulmones durante la metamorfosis. Durante la fase pro-metamórfica, la mejora estructural histológica de la pared alveolar se acompaña de un robusto metabolismo de sustratos y recambio de proteínas. Los pulmones, en la fase de clímax metamórfico, se caracterizan por un aumento en el número de cilios en las células epiteliales alveolares y fibras colágenas en los tejidos conectivos, lo que corresponde a la regulación ascendente de la transcripción de genes relacionados con cilios y la matriz extracelular. Los pulmones post-metamórficos refuerzan su función de contracción, como sugiere el engrosamiento de la capa muscular y la expresión regulada al alza de genes involucrados en la contracción muscular. La barrera sangre-gas está completamente desarrollada en los pulmones adultos, cuyas características transcripcionales son el crecimiento del tejido y la regulación de la diferenciación y la inmunidad. Es importante destacar que cambios transcripcionales significativos de la proteína surfactante pulmonar y la hemoglobina facilitan la respiración aérea. Nuestros resultados iluminaron cuatro pasos clave del desarrollo pulmonar para que los anfibios hagan la transición del agua a la tierra.