El cacao es un cultivo tropical importante y requiere suelos de alta fertilidad para un mejor crecimiento y productividad; sin embargo, los suelos donde se cultiva este cultivo son, en general, ácidos y de baja fertilidad. Por lo tanto, es deseable contar con germoplasma con tolerancia a la acidez del suelo para la mejora genética del cacao. El objetivo de este estudio fue evaluar el germoplasma de cacao en cuanto a crecimiento temprano, concentración de nutrientes y potencial tolerancia a la acidez del suelo. Se llevó a cabo un experimento en invernadero para evaluar 60 genotipos de cacao con diversos orígenes geográficos. Las plántulas de cacao se cultivaron durante seis meses en suelo ácido con y sin cal. Se midieron parámetros de crecimiento y la concentración total de N, P, K, Ca, Mg, Fe, Cu, Mn y Zn en los brotes después de la cosecha. Nuestros resultados indican que los mejores predictores de crecimiento temprano de la tolerancia al suelo ácido son el número de hojas y el área de raíces. La absorción de N, Ca, Mg y K puede tener un papel potencial en la tolerancia a la acidez del suelo. Finalmente, los resultados revelaron una gran diferencia entre los genotipos de cacao en cuanto a sus respuestas al estrés por suelo ácido, lo que llevó a la selección de diez genotipos: CCN-51, PH-21, CCN-10, PAS-91, ICT-1087, ICS-95, UF-667, TSH-565, PH-144, ICT-1189 que son potencialmente tolerantes a la acidez del suelo y podrían ser utilizados para criar variedades de cacao tolerantes a suelos ácidos.