Un estudio transcriptómico y metabolómico sobre la biosíntesis de iridoides en de la meseta Qinghai-Tíbet
Autores: Wang, Luhao; Geng, Guigong; Xie, Huichun; Zhou, Lianyu; He, Yujiao; Li, Zuxia; Qiao, Feng
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Un estudio transcriptómico y metabolómico sobre la biosíntesis de iridoides en de la meseta Qinghai-Tíbet
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Medicina herbal tradicional china
Compuestos iridoides
Metaboloma
Transcriptoma
Expresión génica
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 15
Citaciones: Sin citaciones
es una medicina herbal tradicional china que crece en la región de la meseta Qinghai-Tíbet a una altitud de 3100-5000 m. Los compuestos iridoides son los principales compuestos activos utilizados como ingredientes médicos y muestran propiedades antiinflamatorias, analgésicas y hepatoprotectoras. Para comprender mejor los mecanismos biológicos de los compuestos iridoides en esta especie, realizamos un análisis exhaustivo del transcriptoma y metaboloma de las hojas de cuatro regiones diferentes (3540-4270 m). El perfil global del metaboloma detectó 575 metabolitos, y se detectaron 455 metabolitos acumulados diferencialmente (DAMs) en las hojas de las cuatro regiones. Se investigaron ocho DAMs principales relacionados con el metabolismo de los iridoides en las hojas: éster metílico de shanzhiside, ácido 8-epideoxilogánico, barlerin, shanzhiside, geniposide, agnuside, feretoside y catalpin. Además, se analizaron cinco indicadores físicos y químicos del suelo en los suelos de la rizosfera. Se observaron cuatro correlaciones positivas significativas entre el nitrógeno alcalino y el geniposide, el calcio intercambiable y el geniposide, el potasio disponible y el shanzhiside, y el fósforo disponible y el éster metílico de shanzhiside. Los datos del transcriptoma mostraron 12 bibliotecas de cDNA con 74.46 Gb de datos limpios, que formaron 29,833 unigenes. Además, el 78.91% de los unigenes fueron anotados utilizando las ocho bases de datos públicas. Se identificaron 41 genes candidatos que representan 23 enzimas involucradas en la biosíntesis de compuestos iridoides en las hojas. Además, los genes asociados con la biosíntesis de iridoides se expresaron específicamente en . La integración de los análisis de transcriptoma y metaboloma destaca el papel crucial de los indicadores físicos y químicos del suelo y la expresión génica principal relacionada con las vías de metabolismo de los iridoides en de diferentes áreas. Nuestros hallazgos proporcionan una base teórica para explorar los mecanismos moleculares subyacentes a la acumulación de compuestos iridoides en .
Descripción
es una medicina herbal tradicional china que crece en la región de la meseta Qinghai-Tíbet a una altitud de 3100-5000 m. Los compuestos iridoides son los principales compuestos activos utilizados como ingredientes médicos y muestran propiedades antiinflamatorias, analgésicas y hepatoprotectoras. Para comprender mejor los mecanismos biológicos de los compuestos iridoides en esta especie, realizamos un análisis exhaustivo del transcriptoma y metaboloma de las hojas de cuatro regiones diferentes (3540-4270 m). El perfil global del metaboloma detectó 575 metabolitos, y se detectaron 455 metabolitos acumulados diferencialmente (DAMs) en las hojas de las cuatro regiones. Se investigaron ocho DAMs principales relacionados con el metabolismo de los iridoides en las hojas: éster metílico de shanzhiside, ácido 8-epideoxilogánico, barlerin, shanzhiside, geniposide, agnuside, feretoside y catalpin. Además, se analizaron cinco indicadores físicos y químicos del suelo en los suelos de la rizosfera. Se observaron cuatro correlaciones positivas significativas entre el nitrógeno alcalino y el geniposide, el calcio intercambiable y el geniposide, el potasio disponible y el shanzhiside, y el fósforo disponible y el éster metílico de shanzhiside. Los datos del transcriptoma mostraron 12 bibliotecas de cDNA con 74.46 Gb de datos limpios, que formaron 29,833 unigenes. Además, el 78.91% de los unigenes fueron anotados utilizando las ocho bases de datos públicas. Se identificaron 41 genes candidatos que representan 23 enzimas involucradas en la biosíntesis de compuestos iridoides en las hojas. Además, los genes asociados con la biosíntesis de iridoides se expresaron específicamente en . La integración de los análisis de transcriptoma y metaboloma destaca el papel crucial de los indicadores físicos y químicos del suelo y la expresión génica principal relacionada con las vías de metabolismo de los iridoides en de diferentes áreas. Nuestros hallazgos proporcionan una base teórica para explorar los mecanismos moleculares subyacentes a la acumulación de compuestos iridoides en .