El objetivo principal del estudio fue determinar la biodiversidad de bacterias y su perfil metabólico en la rizosfera de cuatro variedades de trigo de invierno (L.) (Hondia, Nordkap, Rotax, Tytanika) cultivadas en suelo en un sistema de siembra directa. Se aplicaron dos técnicas, es decir, secuenciación de próxima generación (NGS, metabarcoding de la comunidad de ARNr 16S) y perfilamiento fisiológico a nivel de comunidad (CLPP), para obtener una imagen holística de la biodiversidad. También se determinaron los parámetros químicos básicos del suelo (acidez, potencial redox, contenido de carbono, formas de nitrógeno y fósforo). Se encontró que el microbioma rizosférico (a nivel de género) de las variedades de trigo Hondia y Rotax era significativamente diferente al presente en las otras variedades estudiadas. La técnica CLPP demostró que la actividad metabólica microbiana dependía tanto del tipo de sustrato como de las variedades de trigo. Los carbohidratos y los ácidos carboxílicos fueron los compuestos más fácilmente utilizados en todos los suelos rizosféricos. El análisis de componentes principales (PCA) evidenció que los suelos rizosféricos de Rotax y Nordkap se caracterizaban por una mayor actividad funcional (fuerte correlación con el índice de Shannon-Wiener, el índice de Riqueza y la utilización de hidrocarburos) que los de Hondia y Tytanika.