El microbioma del trigo es esencial para su crecimiento y adaptación bajo la actual crisis climática. Los programas de mejoramiento del trigo a menudo se centran principalmente en obtener cultivares más resistentes; por lo tanto, las interacciones genotipo-planta por microbioma han ganado atención. En este sentido, los cultivares locales de trigo representan una oportunidad única para examinar cómo las comunidades bacterianas son reclutadas y apoyan el crecimiento de las plantas en condiciones de campo. En este estudio, exploramos la diversidad, estructura de la comunidad y funciones potenciales de las comunidades bacterianas asociadas a las raíces de cuatro cultivares de trigo chilenos en condiciones de campo mediante Illumina MiSeq. Los análisis mostraron que Proteobacteria fue el filo más abundante en las muestras de endosfera de raíz (51.1 a 74.4%) y rizosfera (39.3 a 44.9%) en los cultivares de trigo. Diferencias significativas.