La exposición al arsénico en niños y adultos se ha asociado con síntomas respiratorios, infecciones respiratorias y disminución de la función pulmonar. El objetivo de este estudio fue evaluar la relación entre la exposición ambiental al arsénico y las pneumoproteínas séricas y la función pulmonar. Se llevó a cabo un estudio transversal que incluyó a 175 niños expuestos al arsénico a través del agua potable (rango: 7.4 a 91 ug/L) y el suelo (rango: 4.76 a 35.93 mg/kg), de algunas aldeas Yaqui. El arsénico se analizó en polvo y orina utilizando espectrometría de fluorescencia de rayos X portátil y ICP/OES, respectivamente. El suero se analizó para la proteína de células Clara (CC16) y la metaloproteinasa de matriz-9 (MMP-9) utilizando inmunoensayos, y la función pulmonar se evaluó mediante espirometría. Los resultados mostraron que el aumento del arsénico en el agua potable se asoció con una reducción en la relación de volumen espiratorio forzado en un segundo (FEV)/capacidad vital forzada (FVC) (beta = -0.027, = 0.0000) mientras que, contrariamente a las expectativas, el arsénico en el polvo se asoció con un aumento en el FEV/FVC (beta = 0.004, = 0.0076). El aumento del arsénico urinario se asoció con una reducción del % FEV predicho (beta = -0.723, = 0.0152) y una reducción en la relación FEV/FVC (beta = -0.022, = 0.0222). El aumento de MMP-9 sérica se asoció con una reducción en la relación FEV/FVC (beta = -0.017, = 0.0167). Los niños con valores de % FEV predicho inferiores a 80 tenían los niveles más bajos de CC16 (Mediana 29.0 ng/mL, IQR 21.3, 37.4, = 0.0148). Como conclusión, nuestro estudio evidenció un deterioro en la función pulmonar en niños expuestos a bajos niveles de arsénico.