Los ARN largos no codificantes (lncARN) son jugadores cruciales que regulan muchos procesos biológicos en las plantas. Sin embargo, hay un conocimiento limitado sobre sus roles en la maduración y ablandamiento del kiwi. En este estudio, utilizando la tecnología de secuenciación de lncARN, se identificaron 591 lncARN expresados diferencialmente (DEL) y 3107 genes expresados diferencialmente (DEG) de kiwis almacenados a 4 grados C durante 1, 2 y 3 semanas en comparación con frutas de control no tratadas. Cabe destacar que se predijo que 645 DEG eran objetivos de DEL (DEGTL), incluidos algunos genes codificadores de proteínas DE (como la beta-amilasa y la pectinesterasa). El análisis de enriquecimiento GO basado en DEGTL reveló que estos genes estaban significativamente enriquecidos en modificación de la pared celular y actividad de pectinesterasa en 1 W vs. CK y 3 W vs. CK, lo que podría estar estrechamente relacionado con el ablandamiento de la fruta durante el almacenamiento a baja temperatura. Además, el análisis de enriquecimiento KEGG reveló que los DEGTL estaban significativamente asociados con el metabolismo de almidón y sacarosa. Nuestro estudio reveló que los lncARN desempeñan roles regulatorios críticos en la maduración y ablandamiento del kiwi durante el almacenamiento a baja temperatura, principalmente mediando la expresión de genes relacionados con el metabolismo de almidón y sacarosa y la modificación de la pared celular.