Este estudio investigó los efectos de la lisina digestible en diferentes fuentes de almidón dietético sobre el metabolismo de lípidos en el hígado y el metabolismo de proteínas en el músculo pectoral en pollos de engorde. El diseño experimental fue un diseño completamente aleatorizado de dos factores 3 x 3. Un total de 702 pollos machos de un día de edad fueron divididos aleatoriamente en nueve tratamientos de seis jaulas replicadas con trece aves cada una. Los tratamientos consistieron en tres fuentes diferentes de almidón (maíz, yuca y maíz ceroso) con tres niveles diferentes de dLys (1.08%, 1.20% y 1.32%). El ensayo duró de 1 a 21 días. Se evaluaron características de la canal, metabolitos séricos, proteínas del músculo pectoral y metabolismo de lípidos en el hígado. Se observó un efecto de interacción significativo (p < 0.05) para las fuentes de almidón dietético y los niveles de dLys en el porcentaje de grasa abdominal y la expresión génica relacionada con el metabolismo de proteínas del músculo pectoral durante todo el período experimental. La dieta de almidón de maíz ceroso y un nivel de dLys del 1.08% en la dieta aumentaron tanto el porcentaje de grasa abdominal (p < 0.01) como el colesterol total en sangre (p < 0.05) en los pollos. La dieta de almidón de maíz ceroso reguló significativamente al alza las expresiones de ARNm de varios genes (p < 0.05). El nivel de dLys del 1.32% reguló significativamente al alza las expresiones de ARNm de otros genes (p < 0.05) y reguló significativamente a la baja las expresiones de ARNm de ciertos genes (p < 0.05). En resumen, la dieta de almidón de maíz ceroso resultó en niveles de expresión significativamente más altos de genes relacionados con la síntesis de grasa que de genes relacionados con la lipólisis, lo que llevó a la deposición de grasa abdominal en los pollos. Aumentar el nivel de dLys en la dieta incrementó el contenido de proteínas en el músculo al promover la síntesis de proteínas e inhibir la degradación de proteínas y también promovió la expresión de genes relacionados con la lipólisis, degradando así la generación de grasa abdominal en los pollos. Nuestros hallazgos indican que aumentar el nivel de dLys al 1.32% al utilizar la dieta de almidón de maíz ceroso podría mejorar las características de la canal.