En los altos Andes, los factores ambientales y socioeconómicos están transformando la agricultura y presumiblemente afectando la conservación in situ de la papa (Solanum spp.). Para monitorear el uso y la conservación de la diversidad intraespecífica, se necesitan estudios sistemáticos y comparativos a través de los sistemas de uso de la tierra agrícola. Investigamos la dinámica espacio-temporal de la papa en dos paisajes de los Andes centrales de Perú: una meseta alta (Huancavelica) en comparación con una ladera oriental (Pasco). Examinamos las asignaciones de área a nivel de hogar, la distribución altitudinal, las prácticas de barbecho sectorial y el estado de conservación de tres grupos principales de cultivares: (i) variedades mejoradas, (ii) landraces harinosos y (iii) landraces amargos. Se utilizaron métodos mixtos para encuestar a 323 hogares y los 1101 campos de papa que gestionaron en 2012-2013. Comparamos la distribución altitudinal contemporánea de los landraces con datos de altímetro de 1975-1985 del Centro Internacional de la Papa. La intensificación está ocurriendo en cada paisaje mientras se mantiene una alta diversidad intraespecífica. El acceso a la tierra y la producción para la venta en comparación con el consumo afectaron significativamente la gestión de los pequeños agricultores y diferenciaron los paisajes. La mayoría de los landraces eran escasos entre los hogares: 45.4% en Huancavelica y 61.7% en Pasco. El cultivo de papa se ha desplazado hacia arriba en un promedio de 306 m desde 1975. La diversidad de landraces es versátil pero está distribuida de manera desigual entre los paisajes. Esto requiere formas adaptativas para incentivar la conservación in situ.