(Franch.) Babc., una planta rica en terpenos que pertenece a la familia Asteraceae, es indígena del suroeste de China. Esta especie ha recibido una atención de investigación limitada y sigue siendo en gran medida desconocida para el público. En este estudio, realizamos una evaluación integral de la raíz medicinal de (Franch.) Babc. examinando sus perfiles de expresión transcripcional, características de acumulación de metabolitos y comunidades microbianas de la rizosfera en varias regiones. A través de un análisis multi-óptico combinado, se observaron patrones distintos de reclutamiento microbiano en la rizosfera de (Franch.) Babc. Notablemente, se identificaron cuatro géneros bacterianos simbióticos clave en las raíces de (Franch.) Babc., a saber, , , , y . Se encontró que los tres primeros géneros exhibían capacidades de biosíntesis de terpenos a mayores altitudes. El género , una bacteria ampliamente distribuida, se encontró involucrado en una variedad de funciones fisiológicas dentro de (Franch.) Babc. en áreas alpinas mediante un análisis de diversificación funcional. Nuestra investigación ha proporcionado valiosos conocimientos sobre las características de acumulación de compuestos bioactivos y los mecanismos de reclutamiento de comunidades microbianas específicas, sentando así una base sólida para el futuro desarrollo y utilización de este recurso vegetal.