Los pequeños rumiantes a menudo sufren trastornos del sistema nervioso central (SNC), y el análisis del líquido cefalorraquídeo (LCR) puede utilizarse como herramienta diagnóstica en este sentido. En animales pequeños y ganado, se han definido patrones específicos de LCR para categorías de enfermedades específicas. No existen datos sobre los resultados del LCR obtenidos de pequeños rumiantes y su asociación con ciertas enfermedades del SNC. El objetivo de este estudio fue investigar retrospectivamente los hallazgos del LCR obtenidos de ovejas y cabras e identificar posibles patrones de LCR asociados con categorías de enfermedades. Se incluyeron en este estudio muestras de LCR y registros médicos de 44 ovejas y 27 cabras. Todos los animales fueron presentados al Hospital Veterinario de Enseñanza de Zúrich de la Facultad de Veterinaria de la Universidad de Zúrich entre 2003 y 2016 y tenían un diagnóstico confirmado de SNC o mostraron cambios en el LCR sin un diagnóstico específico de SNC. La pleocitosis mononuclear mixta fue el patrón de LCR más común en ovejas (25%), seguido de la pleocitosis monocítica (21%). La pleocitosis linfocítica se encontró con mayor frecuencia en cabras (37%). En el 75% de las ovejas y el 56% de las cabras, se diagnosticaron enfermedades infecciosas del SNC, siendo la listeriosis la enfermedad infecciosa más común en ambas especies, seguida de trastornos parasitarios (nematodiasis y coenurosis). Los patrones citológicos del LCR en pequeños rumiantes se basan principalmente en la mayor presencia de células monocíticas y linfocíticas con expresión cuantitativa variable, mientras que la pleocitosis neutrofílica y la disociación citoalbúminica fueron hallazgos raros. Las enfermedades infecciosas de origen bacteriano fueron las causas subyacentes más comunes de las alteraciones del LCR en ovejas y cabras, seguidas de trastornos parasitarios. El tipo de pleocitosis no es útil para diferenciar tipos de enfermedades.