Para determinar el mejor momento para la reproducción, muchos criadores solicitarán exámenes bacteriológicos de la vagina de su perro. Los resultados de estos exámenes son variables, pero en muchos casos se iniciará una terapia antibacteriana en un perro clínicamente sano. Por lo tanto, nuestro objetivo fue investigar la flora vaginal canina fisiológica durante el proestro y el estro, y evaluamos retrospectivamente los hallazgos bacteriológicos de 696 perros de cría sanos, todos ellos pacientes de una sola clínica. Además, los hallazgos bacteriológicos se relacionaron con posibles factores influyentes como la edad, la clase de peso corporal, la longitud del pelaje, el momento de la toma de muestras de hisopos vaginales y la duración del proestro/estro. A pesar de la información sobre el rango fisiológico de las bacterias vaginales, encontramos que la probabilidad de un crecimiento de alta calidad de () y () aumenta con el peso corporal. Además, cuanto antes se realizó la toma de muestras, menor fue el número de cultivos de alta calidad (< 0.01). Adicionalmente, la duración entre la primera y la última medición de progesterona se relacionó positivamente con la detección cultural de spp. y spp. (< 0.05) y negativamente con la cultivación de spp. (< 0.01). Estos hallazgos, en relación con el curso del ciclo de estro, pueden mejorar la interpretación de los hallazgos bacteriológicos cultivados y ayudar a prevenir el uso indebido de antibióticos en la práctica veterinaria.