Actualmente, la detección tridimensional de la estructura de la raíz de las plantas es uno de los problemas centrales en los estudios sobre el fenotipo de la raíz de las plantas. Los métodos de medición manuales no solo son engorrosos, sino que también tienen poca fiabilidad y dañan la raíz. Entre muchas soluciones, la tomografía computarizada de rayos X (TCRX) puede ayudarnos a observar la estructura de la raíz de la planta en una forma tridimensional y no destructiva bajo la condición del suelo subterráneo in situ. Por lo tanto, este documento propone un método y proceso de alto rendimiento para el fenotipo tridimensional de la raíz de la planta y la reconstrucción basada en la tecnología de TCRX. En primer lugar, este documento propone una transmisión de alto rendimiento para el fenotipado de la raíz y utiliza la técnica de imagen para extraer las características de la raíz; luego, el estudio adopta un algoritmo de cubo móvil para reconstruir la raíz tridimensional (3D). Finalmente, esta investigación simula el algoritmo propuesto, y los resultados de la simulación muestran que el método presentado en este documento funciona bien.