Las células madre mesenquimatosas (CMM) tienen propiedades antiinflamatorias significativas y son beneficiosas en modelos de pancreatitis en roedores. La seguridad y eficacia de las CMM es desconocida en perros con pancreatitis aguda (PA). Se identificaron prospectivamente perros con PA que fueron tratados con CMM (n = 4) para este estudio piloto en un hospital académico. Las concentraciones de cPL específico en suero y proteína C-reactiva (PCR) se midieron el día de la administración de CMM y 2 días después. También se calculó la gravedad clínica, a través del Índice de Actividad Clínica Modificado (IACM). Dos perros recibieron CMM poco después del diagnóstico de PA, mientras que los perros restantes recibieron CMM debido a enfermedad clínicamente refractaria. Los cambios en cPL específico, PCR e IACM en los perros tratados con CMM se compararon con una población de control (n = 7) que recibió el tratamiento estándar para PA. No se observaron diferencias significativas entre las poblaciones en los cambios de cPL específico (p = 0.79), PCR (p = 0.67) o IACM (p = 0.91). Sin embargo, se notaron mejoras clínicas subjetivas dentro de las 24 horas posteriores a la infusión de CMM en los dos perros con enfermedad refractaria previamente. Las infusiones de CMM parecen ser seguras en el manejo de la PA en perros y pueden considerarse en enfermedades refractarias. Sin embargo, dada la naturaleza de este estudio piloto y sus limitaciones, se necesitan ensayos clínicos controlados aleatorios más grandes para evaluar verdaderamente la eficacia de las infusiones de CMM en perros con PA.