Un estudio piloto de detección y asociación de la variación de presencia-ausencia de genes en el ganado Holstein
Autores: Boschiero, Clarissa; Neupane, Mahesh; Yang, Liu; Schroeder, Steven G.; Tuo, Wenbin; Ma, Li; Baldwin, Ransom L.; Van Tassell, Curtis P.; Liu, George E.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Un estudio piloto de detección y asociación de la variación de presencia-ausencia de genes en el ganado Holstein
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Variaciones de presencia-ausencia
VPA
Genes
Ganado
Rasgos
Estudios de asociación a nivel genómico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Las variaciones de presencia-ausencia (PAVs) son variaciones estructurales importantes, en las que un segmento genómico que contiene uno o más genes está presente en algunos individuos pero ausente en otros. Aunque las PAVs se han estudiado extensamente en plantas, la investigación en ganado vacuno sigue siendo limitada. Este estudio identificó PAVs en 173 toros Holstein utilizando datos de secuenciación de genoma completo y evaluó sus asociaciones con 46 rasgos económicamente importantes. De 28,772 genes de ganado (de los transcritos más largos), se identificaron un total de 26,979 (93.77%) genes centrales (presentes en todos los individuos), mientras que los genes variables incluyeron 928 softcore (presentes en el 95-99% de los individuos), 494 shell (presentes en el 5-94%) y 371 genes cloud (presentes en
Descripción
Las variaciones de presencia-ausencia (PAVs) son variaciones estructurales importantes, en las que un segmento genómico que contiene uno o más genes está presente en algunos individuos pero ausente en otros. Aunque las PAVs se han estudiado extensamente en plantas, la investigación en ganado vacuno sigue siendo limitada. Este estudio identificó PAVs en 173 toros Holstein utilizando datos de secuenciación de genoma completo y evaluó sus asociaciones con 46 rasgos económicamente importantes. De 28,772 genes de ganado (de los transcritos más largos), se identificaron un total de 26,979 (93.77%) genes centrales (presentes en todos los individuos), mientras que los genes variables incluyeron 928 softcore (presentes en el 95-99% de los individuos), 494 shell (presentes en el 5-94%) y 371 genes cloud (presentes en