La transición de las naciones a fuentes de energía renovable es un hecho, y el despliegue de proyectos de energía renovable (ER) ha aumentado en las últimas décadas. El despliegue de proyectos de energía en islotes deshabitados proporciona una oportunidad prometedora para la transición energética de bajo carbono. Considerando la importancia de la dimensión espacial de los proyectos de ER, en esta investigación, identificamos y clasificamos islotes deshabitados (ID) para el despliegue de parques eólicos en el Mar Egeo del Sur, Grecia. La metodología propuesta combina sistemas de información geográfica (SIG) y dos métodos de análisis multicriterio (AHP y TOPSIS) utilizando algunas restricciones encontradas en la legislación griega, así como criterios de evaluación que consideran aspectos ambientales, económicos y técnicos. Los ID apropiados fueron luego clasificados bajo cuatro escenarios de política diferentes (línea base, pesos de criterios iguales, un escenario de política orientado a criterios técnicos/económicos y un escenario de política centrado en criterios ambientales). Los resultados indicaron la existencia de tres ID para la ubicación de parques eólicos en la región del Egeo del Sur, con la misma clasificación de estos ID bajo diferentes escenarios. La metodología propuesta proporciona pautas útiles para seleccionar ID como sitios para parques eólicos en Grecia y podría aplicarse en otros países del mundo.