Como un cultivo de granos indispensable, el mijo cola de zorro (L.) se está convirtiendo en un alimento funcional en China debido a sus abundantes nutrientes. Sin embargo, la escasa lluvia y la precipitación desigual limitan su crecimiento y producción, especialmente en el noroeste de China. Comprender las características fenotípicas de la raíz del mijo cola de zorro es fundamental para utilizar sus características de raíz para criar nuevas variedades de mijo con una mayor eficiencia en el uso de recursos y una mejor adaptación a entornos difíciles. El presente estudio caracterizó la variabilidad de los rasgos morfológicos de la raíz en la etapa de plántula de 65 genotipos de mijo seleccionados de cuatro regiones ecológicas en siete provincias de China. Las plantas fueron evaluadas después de 21 días de crecimiento en bolsas de germinación, y se midieron 48 rasgos de raíz y brote. Los resultados mostraron una gran variación entre los genotipos en los rasgos de crecimiento y funcionales. Entre los rasgos medidos, la masa seca de la raíz, la longitud máxima de la raíz, el área superficial de la raíz y la densidad del tejido de la raíz contribuyeron más a los componentes principales. La proporción del área superficial de la raíz y la proporción del volumen de la raíz estaban significativamente correlacionadas con la proporción de la longitud de la raíz, respectivamente, mientras que la densidad de la longitud de la raíz y la densidad del peso de la raíz estaban correlacionadas negativamente con el diámetro de la raíz ( < 0.01). La masa seca del brote, el número de raíces, la longitud de la raíz, la masa seca de la raíz y la masa seca total estaban estrechamente correlacionados entre sí. La longitud de la raíz y el área superficial de la raíz en cada sección de 5 cm disminuyeron de arriba hacia abajo a lo largo del sistema de raíces. Entre las cuatro regiones ecológicas, los genotipos del área de maduración temprana del noroeste de China tenían la mayor longitud de raíz, masa seca del brote, masa seca de la raíz y densidad de la raíz, mientras que los del área de maduración temprana del noroeste de China generalmente tenían el sistema de raíces más grande, con aproximadamente 2,2 veces más longitud de raíz y peso seco que los del área de maduración temprana del noreste de China (el sistema de raíces más corto). La variabilidad genotípica en los rasgos de la raíz y las correlaciones entre los rasgos del brote y de la raíz forman una base para criar nuevas variedades de mijo.