La calidad de la carne de cerdo está significativamente asociada con su contenido de grasa intramuscular (IMF). En los últimos años, se han documentado bien las asociaciones de los microbios intestinales con la deposición de grasa en varios animales. Sin embargo, los estudios sobre microbios intestinales suelen utilizar muestras fecales como un proxy. Dado que la composición y diversidad de microorganismos varían significativamente entre los diferentes segmentos gastrointestinales, las muestras fecales pueden no reflejar con precisión la distribución espacial de las especies microbianas entre las distintas regiones intestinales. Esta investigación se basó en la secuenciación del ARN ribosómico 16S microbiano para identificar categorías de microflora intestinal influyentes que impactan el contenido de IMF en seis segmentos intestinales distintos (duodeno, yeyuno, íleon, ciego, colon y recto) y señaló el segmento principal que influye en el contenido de IMF. Estos hallazgos proporcionan una base teórica para modular los microbios intestinales y aumentar la calidad del cerdo y el contenido de IMF.