Con la profunda integración de la tecnología digital y la agricultura tradicional, toda la cadena industrial del comercio electrónico rural, como un sistema avanzado, está remodelando los modelos de producción, ventas y gestión de la agricultura y está surgiendo como un nuevo catalizador para el avance de la agricultura digital a través de una innovación significativa. Este documento se centra en los atributos de empoderamiento digital y los atributos estratégicos de toda la cadena industrial del comercio electrónico rural, y se construyen modelos de juego evolutivo bajo mecanismos y regulaciones de mercado. Examina la influencia de varios elementos, como el coeficiente de empoderamiento de la tecnología digital, en la innovación colaborativa dentro de toda la cadena industrial del comercio electrónico rural. Utilizando simulaciones de casos, este documento discute el papel de la regulación e intervención gubernamental cuando los mecanismos de mercado son inadecuados. El estudio revela que factores como el coeficiente de empoderamiento de la tecnología digital, la capacidad de absorción de tecnología y la cantidad de tecnología e información almacenada en la innovación colaborativa influyen positivamente en toda la cadena industrial. Las pérdidas por riesgos potenciales y las ganancias de los free-riders tienen efectos negativos en la evolución del sistema hacia la innovación colaborativa. Cuando los mecanismos de mercado son inadecuados, una combinación de subsidios a los costos operativos y medidas de incentivo puede generar una sinergia política más efectiva, siendo particularmente notable el impacto de incentivo de los subsidios a los costos. La aplicación estratégica de daños liquidados por la empresa y sanciones gubernamentales ayudará a regular y dirigir el comportamiento corporativo. Los hallazgos de esta investigación no solo ofrecen una nueva explicación a nivel micro para entender el mecanismo de toma de decisiones detrás de la innovación colaborativa en toda la cadena industrial del comercio electrónico rural, sino que también sirven como referencia para la formulación de políticas gubernamentales para garantizar la estabilidad de toda la cadena industrial del comercio electrónico rural.