El estudio de los diferentes compartimentos hidrogeológicos es un requisito previo para comprender y monitorear diferentes flujos, evaluando así los cambios ambientales en un ecosistema donde están presentes perturbaciones antropogénicas con el fin de preservar las aguas subterráneas más vulnerables de la contaminación y la degradación. En muchos dominios kársticos del Mediterráneo, las aguas subterráneas y las aguas superficiales son un único sistema, como resultado de las características que facilitan la ingresión de aguas de la superficie al subsuelo. Este también es el caso de la hidroestructura del Karst Clásico, que es una meseta de carbonato que se eleva sobre el mar Adriático septentrional, compartida entre Italia y Eslovenia. Los principales proveedores del acuífero son las precipitaciones efectivas y las aguas de tres ríos diferentes: Reka/Timavo, Soa/Isonzo y Vipava/Vipacco. Los estudios hidrogeológicos pasados y en curso en la zona se han centrado en las conexiones dentro del sistema acuífero de la Región Kárstica Clásica a través del análisis de las hidrográficas y quimiográficas de cuevas de agua y manantiales. En este artículo, los autores presentan nuevos datos combinados de iones principales, oxígeno, hidrógeno e isótopos estables y radiogénicos de estroncio que han permitido un conocimiento más complementario de la circulación de aguas subterráneas, su procedencia e interacciones agua-roca. Todas las acciones ocurrieron en el marco del proyecto europeo HYDROKARST.