El gen del grupo de alta movilidad AT-hook 2 ha sido ampliamente estudiado en el contexto del cáncer y el crecimiento animal. Sin embargo, recientemente, varios estudios han descubierto su papel crítico en la proliferación celular. Un estudio de asociación del genoma completo (GWAS) sugiere además que el gen es un candidato en fertilidad, lo que indica su conexión no solo con rasgos de crecimiento, sino también con la reproducción, específicamente con rasgos ováricos. Así, este estudio tuvo como objetivo analizar la distribución del gen en 54 razas bovinas en todo el mundo, identificar variantes importantes de fragmentos cortos (indels) e investigar la relación entre el desarrollo ovárico. El conjunto de datos incluyó información genotípica de una población bovina de 634 individuos (n = 634). Después de genotipar y analizar cuatro loci seleccionados, encontramos que uno de los cuatro loci, rs133750033 (P4-D), era polimórfico. Nuestros resultados también revelan que este indel está significativamente asociado con ciertos rasgos ováricos (p < 0.05). Específicamente, tiene conexión con la longitud ovárica (p = 0.004) y la altura ovárica (p = 0.026) durante el diestro. Además, descubrimos una mayor expresión del gen en razas de ganado asiático. En resumen, este estudio sugiere que tiene el potencial de servir como un marcador genético para pruebas de fertilidad animal. Además, estos hallazgos contribuyen a una perspectiva más prometedora para la industria bovina.