subsp. (), un patógeno de cuarentena en la Unión Europea, amenaza gravemente la producción de aceitunas en el Mediterráneo, especialmente en el sur de Italia, donde el Síndrome de Declive Rápido del Olivo (OQDS) ha devastado los olivares de Apulia. Este estudio aborda la urgente necesidad de identificar genotipos de olivo resistentes mediante el monitoreo de 16 genotipos potencialmente tolerantes durante seis años, evaluando la gravedad de los síntomas y la carga bacteriana. Estos genotipos, que sobrevivieron en áreas con alta infección, mostraron respuestas variadas; algunos mantuvieron una baja gravedad de síntomas con una presencia bacteriana mínima (valores de Cq altos o indetectables), mientras que otros exhibieron cargas bacterianas aumentadas pero permanecieron asintomáticos o mostraron una desecación limitada del dosel. Se utilizaron marcadores SSR para investigar las relaciones genéticas entre estos genotipos y otros cultivares mediterráneos ampliamente distribuidos, mostrando similitud genética con los resistentes como el Kalinjot albanés y el Leucocarpa griego, así como con cultivares locales de Apulia, destacando el potencial del germoplasma local y mediterráneo para la resistencia. Este estudio integra respuestas fenotípicas con conocimiento genético para apoyar el desarrollo de estrategias de conservación que mejoren la diversidad genética de los cultivares de olivo de Apulia. Además, al centrarse en la resiliencia de los diferentes genotipos de olivo, esta investigación tiene como objetivo proteger los cultivares tradicionales de las amenazas emergentes, preservando así el patrimonio ecológico y cultural de la biodiversidad del olivo en la región mediterránea.