Investigación exhaustiva a nivel genómico y regulación transcripcional de la familia de genes bZIP en el desarrollo del fruto de lichi
Autores: Liu, Jiaxuan; Silaiyiman, Saimire; Wu, Jiaxin; Ouyang, Lejun; Cao, Zheng; Shen, Chao
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Investigación exhaustiva a nivel genómico y regulación transcripcional de la familia de genes bZIP en el desarrollo del fruto de lichi
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Tropical
Subtropical
Familia de genes bzip
Lichi
Desarrollo de frutas
Características moleculares
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
, un árbol frutal tropical y subtropical crucial en el sur de China, es ampliamente apreciado por su sabor distintivo, alto valor nutricional y significativo impacto económico. La familia de genes bZIP (básica de leucina con cremallera) desempeña un papel esencial en la regulación de funciones biológicas clave durante el crecimiento y desarrollo de las plantas. En este estudio, realizamos un análisis bioinformático integral de la familia de genes bZIP en litchi para elucidar sistemáticamente sus características moleculares y propiedades funcionales. Se identificaron un total de 55 miembros de la familia de genes bZIP, con las proteínas codificadas que contienen entre 129 y 845 residuos de aminoácidos y puntos isoeléctricos teóricos (pI) que varían de 4.85 a 10.23. El análisis de la red de interacción proteína-proteína reveló que 46 proteínas exhibieron relaciones de interacción. El análisis filogenético clasificó estos genes en 13 subgrupos distintos (A-K, M y S). El análisis de localización cromosómica indicó que los miembros de la familia de genes bZIP fueron mapeados con éxito a 15 cromosomas. El análisis de colinealidad intraespecífica identificó 39 eventos de duplicación segmentaria, mientras que los análisis de colinealidad interespecífica y de un solo gen sugirieron conservación evolutiva, con solo unos pocos genes que exhibieron eventos de duplicación o pérdida. El análisis de elementos cis-actuantes reveló un total de 213 elementos asociados con el crecimiento y desarrollo, que pueden desempeñar un papel importante en la regulación del desarrollo del fruto. Los resultados de la expresión diferencial de genes, relacionados con el desarrollo del fruto a través de diferentes cultivares, tejidos y etapas de floración, combinados con la validación de qRT-PCR, sugieren que pueden estar involucrados en la regulación temprana del desarrollo del fruto, mientras que pueden desempeñar un papel regulador durante las etapas posteriores del desarrollo del fruto. Estos hallazgos proporcionan una sólida base teórica para comprender los roles de los genes bZIP en el crecimiento y desarrollo del fruto de litchi, y sientan las bases para futuros estudios funcionales. Este estudio tiene un valor potencial de aplicación en el desarrollo y mejora genética del fruto de litchi.
Descripción
, un árbol frutal tropical y subtropical crucial en el sur de China, es ampliamente apreciado por su sabor distintivo, alto valor nutricional y significativo impacto económico. La familia de genes bZIP (básica de leucina con cremallera) desempeña un papel esencial en la regulación de funciones biológicas clave durante el crecimiento y desarrollo de las plantas. En este estudio, realizamos un análisis bioinformático integral de la familia de genes bZIP en litchi para elucidar sistemáticamente sus características moleculares y propiedades funcionales. Se identificaron un total de 55 miembros de la familia de genes bZIP, con las proteínas codificadas que contienen entre 129 y 845 residuos de aminoácidos y puntos isoeléctricos teóricos (pI) que varían de 4.85 a 10.23. El análisis de la red de interacción proteína-proteína reveló que 46 proteínas exhibieron relaciones de interacción. El análisis filogenético clasificó estos genes en 13 subgrupos distintos (A-K, M y S). El análisis de localización cromosómica indicó que los miembros de la familia de genes bZIP fueron mapeados con éxito a 15 cromosomas. El análisis de colinealidad intraespecífica identificó 39 eventos de duplicación segmentaria, mientras que los análisis de colinealidad interespecífica y de un solo gen sugirieron conservación evolutiva, con solo unos pocos genes que exhibieron eventos de duplicación o pérdida. El análisis de elementos cis-actuantes reveló un total de 213 elementos asociados con el crecimiento y desarrollo, que pueden desempeñar un papel importante en la regulación del desarrollo del fruto. Los resultados de la expresión diferencial de genes, relacionados con el desarrollo del fruto a través de diferentes cultivares, tejidos y etapas de floración, combinados con la validación de qRT-PCR, sugieren que pueden estar involucrados en la regulación temprana del desarrollo del fruto, mientras que pueden desempeñar un papel regulador durante las etapas posteriores del desarrollo del fruto. Estos hallazgos proporcionan una sólida base teórica para comprender los roles de los genes bZIP en el crecimiento y desarrollo del fruto de litchi, y sientan las bases para futuros estudios funcionales. Este estudio tiene un valor potencial de aplicación en el desarrollo y mejora genética del fruto de litchi.