Análisis a nivel genómico de la familia de genes y exploración funcional en la respuesta a bajas temperaturas
Autores: Yang, Yanbo; Cai, Qihang; Luo, Li; Sun, Zhenghai; Li, Liping
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis a nivel genómico de la familia de genes y exploración funcional en la respuesta a bajas temperaturas
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Familia de genes
Resistencia al estrés
Secuenciación a nivel genómico
Expresión específica de tejidos
Estrés por bajas temperaturas
Tecnología VIGS
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
es un pariente cercano de los pimientos comestibles con alto valor económico. La familia de genes juega un papel importante en la fisiología de la resistencia al estrés en las plantas. Detectamos un total de cinco genes en los datos de secuenciación del genoma. Estos genes estaban dispersos de manera irregular a través de cuatro cromosomas. Los genes se categorizaron en tres agrupaciones de acuerdo con sus relaciones evolutivas, con genes en la misma categoría mostrando principios comparables para la composición de motivos. Los 2000 pb aguas arriba de contienen muchos elementos responsivos a la resistencia, elementos responsivos a hormonas y sitios de unión de factores de transcripción. Estos hallazgos enfatizan las funciones cruciales de estos genes en la respuesta a condiciones desafiantes y la regulación fisiológica. El análisis de la expresión específica de tejidos reveló que mostró el mayor nivel de expresión entre todos los tejidos. Bajo condiciones de estrés por bajas temperaturas, todos los genes mostraron diferentes niveles de respuesta, con mostrando una considerable regulación al alza después de 0.25 h de estrés por frío, indicando una alta sensibilidad a la respuesta a bajas temperaturas. La importancia del gen en la respuesta al frío de fue confirmada por el uso de la tecnología de silenciamiento génico inducido por virus (VIGS), así como por la predicción de su red de interacción proteica. Para resumir, este estudio realiza una exhaustiva investigación bioinformática de la familia de genes, muestra la practicidad de emplear la tecnología VIGS en , y confirma la importancia del gen en respuesta a bajas temperaturas. Estos hallazgos proporcionan referencias significativas para futuras investigaciones sobre la adaptación a bajas temperaturas.
Descripción
es un pariente cercano de los pimientos comestibles con alto valor económico. La familia de genes juega un papel importante en la fisiología de la resistencia al estrés en las plantas. Detectamos un total de cinco genes en los datos de secuenciación del genoma. Estos genes estaban dispersos de manera irregular a través de cuatro cromosomas. Los genes se categorizaron en tres agrupaciones de acuerdo con sus relaciones evolutivas, con genes en la misma categoría mostrando principios comparables para la composición de motivos. Los 2000 pb aguas arriba de contienen muchos elementos responsivos a la resistencia, elementos responsivos a hormonas y sitios de unión de factores de transcripción. Estos hallazgos enfatizan las funciones cruciales de estos genes en la respuesta a condiciones desafiantes y la regulación fisiológica. El análisis de la expresión específica de tejidos reveló que mostró el mayor nivel de expresión entre todos los tejidos. Bajo condiciones de estrés por bajas temperaturas, todos los genes mostraron diferentes niveles de respuesta, con mostrando una considerable regulación al alza después de 0.25 h de estrés por frío, indicando una alta sensibilidad a la respuesta a bajas temperaturas. La importancia del gen en la respuesta al frío de fue confirmada por el uso de la tecnología de silenciamiento génico inducido por virus (VIGS), así como por la predicción de su red de interacción proteica. Para resumir, este estudio realiza una exhaustiva investigación bioinformática de la familia de genes, muestra la practicidad de emplear la tecnología VIGS en , y confirma la importancia del gen en respuesta a bajas temperaturas. Estos hallazgos proporcionan referencias significativas para futuras investigaciones sobre la adaptación a bajas temperaturas.