La Comune di Sicilia, una raza local de cabras de Sicilia (Italia), está actualmente en proceso de reconocimiento como una raza distinta. Este estudio tiene como objetivo caracterizar la población tanto fenotípicamente como genómicamente para avanzar en su proceso de reconocimiento. Se inscribieron un total de 78 sujetos de dos localidades, y se registraron y analizaron estadísticamente sus datos fenotípicos, incluyendo rasgos cualitativos y medidas morfométricas de animales adultos. Las cabras fueron genotipadas utilizando el Illumina 50 k Goat SNPchip, comparándolas con 473 cabras de 15 razas italianas. Se analizaron la estructura poblacional, las relaciones filogenéticas, la mezcla y la endogamia genómica. Además, se compararon sujetos con diferentes rasgos morfológicos utilizando F y tramos de homocigosidad, lo que llevó a la identificación de posibles genes candidatos asociados con la anotia y la presencia de papada en las cabras. La raza Comune di Sicilia exhibió características genómicas y fenotípicas distintivas, diferenciándola de otras razas en la misma región. Sin embargo, también se observó una variabilidad moderada, posiblemente influenciada por prácticas de selección. Para garantizar la preservación de la raza y prevenir la endogamia excesiva, se recomienda un enfoque integral que considere tanto la morfología como el trasfondo genómico. Este estudio contribuye con valiosos conocimientos sobre las peculiaridades genéticas de la cabra Comune di Sicilia, apoyando su reconocimiento como una raza única y valiosa.