Análisis a nivel genómico y perfilado de expresión de la fosfatasa de trehalosa-6-fosfato (TPP) en respuesta al estrés por sequía mediado por ácido abscísico
Autores: Omari Alzahrani, Fatima
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis a nivel genómico y perfilado de expresión de la fosfatasa de trehalosa-6-fosfato (TPP) en respuesta al estrés por sequía mediado por ácido abscísico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Trehalosa
Enzima
TPP
Granada
Respuesta al estrés
Desarrollo
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
La trehalosa, un disacárido no reductor, se ha relacionado con el crecimiento y desarrollo de las plantas, así como con la respuesta al estrés. La enzima trehalosa-6-fosfato fosfatasa (TPP) desempeña un papel crucial en la producción de trehalosa en plantas superiores. Este estudio identificó un total de siete genes de la familia TPP dentro de la especie de granada. Se identificaron tres subgrupos de los siete PgTPPs a través de un análisis filogenético. Se estudiaron la longitud del gen, la longitud de la secuencia codificante (CD) y la ubicación cromosómica de los genes. Además, se examinaron la longitud de las proteínas PgTPP, el punto isoeléctrico (Ip), el promedio general de hidropatía (GRAVY), los dominios conservados, los motivos conservados, la sinencia y las relaciones filogenéticas con las proteínas TPP de Arabidopsis y tomate. También se evaluaron los elementos cis-actuantes en la región del promotor y la expresión de los genes bajo estrés hídrico mediado por ácido abscísico (ABA), así como las diferencias en la expresión en los tejidos de raíz, flor y hoja. Los genes están involucrados en la respuesta al estrés hídrico mediado por ácido abscísico, como lo muestran los transcriptomas mediadores del estrés por sequía. Los genes se expresaron solo en tejido floral y raíces, respectivamente. Los restantes no mostraron alteraciones significativas en la expresión génica en raíces, flores o hojas. El estudio actual tiene el potencial de proporcionar una comprensión integral de las características biológicas de las proteínas PgTPP en varios procesos de desarrollo y su papel en la respuesta de la planta de granada a diferentes estresores. Sin embargo, se requiere más investigación para explorar su papel biológico preciso. Por lo tanto, realizar un estudio de validación funcional integral sobre PgTPPs podría contribuir al desarrollo de cultivares agrícolas resistentes al estrés.
Descripción
La trehalosa, un disacárido no reductor, se ha relacionado con el crecimiento y desarrollo de las plantas, así como con la respuesta al estrés. La enzima trehalosa-6-fosfato fosfatasa (TPP) desempeña un papel crucial en la producción de trehalosa en plantas superiores. Este estudio identificó un total de siete genes de la familia TPP dentro de la especie de granada. Se identificaron tres subgrupos de los siete PgTPPs a través de un análisis filogenético. Se estudiaron la longitud del gen, la longitud de la secuencia codificante (CD) y la ubicación cromosómica de los genes. Además, se examinaron la longitud de las proteínas PgTPP, el punto isoeléctrico (Ip), el promedio general de hidropatía (GRAVY), los dominios conservados, los motivos conservados, la sinencia y las relaciones filogenéticas con las proteínas TPP de Arabidopsis y tomate. También se evaluaron los elementos cis-actuantes en la región del promotor y la expresión de los genes bajo estrés hídrico mediado por ácido abscísico (ABA), así como las diferencias en la expresión en los tejidos de raíz, flor y hoja. Los genes están involucrados en la respuesta al estrés hídrico mediado por ácido abscísico, como lo muestran los transcriptomas mediadores del estrés por sequía. Los genes se expresaron solo en tejido floral y raíces, respectivamente. Los restantes no mostraron alteraciones significativas en la expresión génica en raíces, flores o hojas. El estudio actual tiene el potencial de proporcionar una comprensión integral de las características biológicas de las proteínas PgTPP en varios procesos de desarrollo y su papel en la respuesta de la planta de granada a diferentes estresores. Sin embargo, se requiere más investigación para explorar su papel biológico preciso. Por lo tanto, realizar un estudio de validación funcional integral sobre PgTPPs podría contribuir al desarrollo de cultivares agrícolas resistentes al estrés.