Un Estudio de Asociación a Nivel del Genoma de Germoplasma de Sorgo Nigeriano y Senegalés, el Agente Causal de la Mancha Foliar
Autores: Prom, Louis K.; Botkin, Jacob R.; Ahn, Ezekiel J. S.; Sarr, Mame Penda; Diatta, Cyril; Fall, Coumba; Magill, Clint W.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Un Estudio de Asociación a Nivel del Genoma de Germoplasma de Sorgo Nigeriano y Senegalés, el Agente Causal de la Mancha Foliar
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Sorgo
Mancha foliar
Accesiones
Incidencia
Severidad
Resistencia
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
En Senegal, el sorgo ocupa el tercer lugar después del mijo y el maíz en la producción de cereales de secano y juega un papel crítico en la vida diaria de millones de habitantes. Sin embargo, la productividad y rentabilidad del cultivo se ven obstaculizadas por estrés biótico, incluyendo la mancha foliar. Un total de 101 accesiones de sorgo recolectadas de Níger y Senegal, SC748-5 y BTx623, fueron evaluadas en tres entornos diferentes (Kaymor, Kolda y Ndiaganiao) en Senegal por sus reacciones contra el patógeno de la mancha foliar. Los resultados mostraron que 11 de las 101 accesiones evaluadas exhibieron una incidencia del 100%, y la incidencia media general fue del 88.4%. La accesión N15 tuvo la incidencia más baja del 50%. La severidad media general fue del 31.6%, mientras que las accesiones N15, N43, N38, N46, N30, N28 y N23 de Níger registraron los niveles de severidad más bajos, que oscilaban entre el 15.5% y el 25.5%. La accesión N15 mostró tanto una baja incidencia como severidad de la mancha foliar, lo que indica que puede poseer genes de resistencia. Además, las accesiones evaluadas en este estudio fueron secuenciadas. Un GWAS identificó seis nuevos polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) asociados con una tasa media de incidencia de mancha foliar. Los genes candidatos se encontraron en los cromosomas 2, 3, 5, 8 y 9. Excepto por el locus SNP S05_48064154, los otros cinco SNPs asociados con la tasa de incidencia de mancha foliar estaban relacionados con la defensa de la planta y las respuestas al estrés. En conclusión, los genes candidatos identificados podrían ofrecer opciones adicionales para mejorar la resistencia de las plantas a través de la mejora genética o la edición de genes.
Descripción
En Senegal, el sorgo ocupa el tercer lugar después del mijo y el maíz en la producción de cereales de secano y juega un papel crítico en la vida diaria de millones de habitantes. Sin embargo, la productividad y rentabilidad del cultivo se ven obstaculizadas por estrés biótico, incluyendo la mancha foliar. Un total de 101 accesiones de sorgo recolectadas de Níger y Senegal, SC748-5 y BTx623, fueron evaluadas en tres entornos diferentes (Kaymor, Kolda y Ndiaganiao) en Senegal por sus reacciones contra el patógeno de la mancha foliar. Los resultados mostraron que 11 de las 101 accesiones evaluadas exhibieron una incidencia del 100%, y la incidencia media general fue del 88.4%. La accesión N15 tuvo la incidencia más baja del 50%. La severidad media general fue del 31.6%, mientras que las accesiones N15, N43, N38, N46, N30, N28 y N23 de Níger registraron los niveles de severidad más bajos, que oscilaban entre el 15.5% y el 25.5%. La accesión N15 mostró tanto una baja incidencia como severidad de la mancha foliar, lo que indica que puede poseer genes de resistencia. Además, las accesiones evaluadas en este estudio fueron secuenciadas. Un GWAS identificó seis nuevos polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) asociados con una tasa media de incidencia de mancha foliar. Los genes candidatos se encontraron en los cromosomas 2, 3, 5, 8 y 9. Excepto por el locus SNP S05_48064154, los otros cinco SNPs asociados con la tasa de incidencia de mancha foliar estaban relacionados con la defensa de la planta y las respuestas al estrés. En conclusión, los genes candidatos identificados podrían ofrecer opciones adicionales para mejorar la resistencia de las plantas a través de la mejora genética o la edición de genes.