Análisis del genoma completo de la familia de genes de Xyloglucan Endotransglucosylase/Hydrolase (): Patrón de expresión durante el tratamiento de estrés por magnesio en las hojas de la planta de morera (L.)
Autores: Danso, Blessing; Ackah, Michael; Jin, Xin; Ayittey, Derek M.; Amoako, Frank Kwarteng; Zhao, Weiguo
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Análisis del genoma completo de la familia de genes de Xyloglucan Endotransglucosylase/Hydrolase (): Patrón de expresión durante el tratamiento de estrés por magnesio en las hojas de la planta de morera (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Mora
Magnesio
Genes
Tolerancia al estrés
Análisis del transcriptoma
Xiloglucano
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
La morera (L.), un cultivo de árbol frutal significativo, requiere magnesio (Mg) para su crecimiento y productividad óptimos. No obstante, nuestra comprensión de la base molecular subyacente a la tolerancia al estrés por magnesio en las plantas de morera sigue sin explorarse. En nuestro estudio anterior, identificamos varios genes candidatos diferenciales asociados con la homeostasis de Mg a través de un análisis de transcriptoma, incluyendo la familia de genes de endotransglucosilasa/hidrolasa de xiloglucano. La familia de genes es crucial para la reconstrucción de la pared celular de las plantas y las respuestas al estrés. Estos genes han sido identificados e investigados a fondo en varias especies de plantas. Sin embargo, no hay investigaciones relacionadas con los genes dentro de la planta. Esta investigación examinó sistemáticamente la familia de genes a nivel genómico utilizando un enfoque bioinformático. En total, se descubrieron 22 genes que contenían los dominios conservados Glyco_hydro_16 y XET_C. Los genes se categorizaron en cinco grupos distintos según sus relaciones filogenéticas. La estructura del gen posee cuatro exones y tres intrones. Además, el análisis del promotor del gen revela una plétora de elementos cis-regulatorios, principalmente de respuesta al estrés, respuesta a fitohormonas y crecimiento y desarrollo. El análisis de GO indicó que los genes codifican proteínas que exhiben actividades de transferasa y hidrolasa de xiloglucano, además de biogénesis de la pared celular, así como procesos metabólicos de xiloglucano y carbohidratos. Además, un análisis de sinonimia reveló una relación evolutiva entre los genes en y aquellos en tres otras especies: . , . , y . Los perfiles de expresión de los datos de RNA-Seq mostraron patrones de expresión distintos de los genes en el tejido foliar de durante los tratamientos con Mg. El análisis de PCR cuantitativa en tiempo real confirmó la expresión de los genes en la respuesta al estrés por Mg. En general, esta investigación mejora nuestra comprensión de las características de los miembros de la familia de genes y sienta las bases para futuros estudios genómicos funcionales en .
Descripción
La morera (L.), un cultivo de árbol frutal significativo, requiere magnesio (Mg) para su crecimiento y productividad óptimos. No obstante, nuestra comprensión de la base molecular subyacente a la tolerancia al estrés por magnesio en las plantas de morera sigue sin explorarse. En nuestro estudio anterior, identificamos varios genes candidatos diferenciales asociados con la homeostasis de Mg a través de un análisis de transcriptoma, incluyendo la familia de genes de endotransglucosilasa/hidrolasa de xiloglucano. La familia de genes es crucial para la reconstrucción de la pared celular de las plantas y las respuestas al estrés. Estos genes han sido identificados e investigados a fondo en varias especies de plantas. Sin embargo, no hay investigaciones relacionadas con los genes dentro de la planta. Esta investigación examinó sistemáticamente la familia de genes a nivel genómico utilizando un enfoque bioinformático. En total, se descubrieron 22 genes que contenían los dominios conservados Glyco_hydro_16 y XET_C. Los genes se categorizaron en cinco grupos distintos según sus relaciones filogenéticas. La estructura del gen posee cuatro exones y tres intrones. Además, el análisis del promotor del gen revela una plétora de elementos cis-regulatorios, principalmente de respuesta al estrés, respuesta a fitohormonas y crecimiento y desarrollo. El análisis de GO indicó que los genes codifican proteínas que exhiben actividades de transferasa y hidrolasa de xiloglucano, además de biogénesis de la pared celular, así como procesos metabólicos de xiloglucano y carbohidratos. Además, un análisis de sinonimia reveló una relación evolutiva entre los genes en y aquellos en tres otras especies: . , . , y . Los perfiles de expresión de los datos de RNA-Seq mostraron patrones de expresión distintos de los genes en el tejido foliar de durante los tratamientos con Mg. El análisis de PCR cuantitativa en tiempo real confirmó la expresión de los genes en la respuesta al estrés por Mg. En general, esta investigación mejora nuestra comprensión de las características de los miembros de la familia de genes y sienta las bases para futuros estudios genómicos funcionales en .