La disección genética de los loci de tolerancia a bentazona en soja cultivada: un estudio de asociación a nivel genómico
Autores: Jo, Hyun; Ali, Liakat; Song, Jong Tae; Lee, Jeong-Dong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
La disección genética de los loci de tolerancia a bentazona en soja cultivada: un estudio de asociación a nivel genómico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Malezas
Bentazona
Soja
Loci genéticos
Estudio de asociación de todo el genoma
SNPs
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 26
Citaciones: Sin citaciones
Las malas hierbas solas causan una pérdida del 37% en la producción alcanzable de soja. Bentazona es un herbicida de postemergencia utilizado para controlar las malas hierbas de hoja ancha en el cultivo de cereales, legumbres, verduras y tubérculos. Este estudio tuvo como objetivo examinar las colecciones coreanas de soja cultivada en relación con la bentazona, identificando los loci genéticos que controlan las reacciones a la bentazona en las colecciones de soja cultivada utilizando un estudio de asociación a nivel genómico (GWAS). Este estudio identificó germoplasmas de soja tolerantes y sensibles a la bentazona de 418 germoplasmas de soja cultivada y encontró que la tolerancia moderada a la bentazona predominaba en la colección coreana de soja cultivada. El GWAS reveló que 42 SNPs distribuidos en los cromosomas 3, 5, 6, 13 y 20 estaban fuertemente asociados con la reacción a la bentazona en 418 accesiones de soja cultivada a lo largo de tres años. De estos loci, una región genómica en el cromosoma 5 contenía SNPs significativos y se identificó como involucrada en la reacción a la bentazona en 2020 y 2021, según el análisis de FarmCPU. Al realizar un análisis de haplotipos, este estudio identificó cinco genes potenciales, a saber, (transportador de la proteína de unión a ATP), (desconocido), (proteína de la familia de repeticiones de anquirina), (proteína transportadora de aminoácidos transmembrana) y (desconocido). Se requieren más estudios para confirmar la participación de los genes potenciales en la reacción a la bentazona comparando sus niveles de expresión entre plantas tolerantes y sensibles a la bentazona. Por lo tanto, los resultados de este estudio pueden ser utilizados para la selección asistida por marcadores en programas para la cría de soja tolerante a herbicidas.
Descripción
Las malas hierbas solas causan una pérdida del 37% en la producción alcanzable de soja. Bentazona es un herbicida de postemergencia utilizado para controlar las malas hierbas de hoja ancha en el cultivo de cereales, legumbres, verduras y tubérculos. Este estudio tuvo como objetivo examinar las colecciones coreanas de soja cultivada en relación con la bentazona, identificando los loci genéticos que controlan las reacciones a la bentazona en las colecciones de soja cultivada utilizando un estudio de asociación a nivel genómico (GWAS). Este estudio identificó germoplasmas de soja tolerantes y sensibles a la bentazona de 418 germoplasmas de soja cultivada y encontró que la tolerancia moderada a la bentazona predominaba en la colección coreana de soja cultivada. El GWAS reveló que 42 SNPs distribuidos en los cromosomas 3, 5, 6, 13 y 20 estaban fuertemente asociados con la reacción a la bentazona en 418 accesiones de soja cultivada a lo largo de tres años. De estos loci, una región genómica en el cromosoma 5 contenía SNPs significativos y se identificó como involucrada en la reacción a la bentazona en 2020 y 2021, según el análisis de FarmCPU. Al realizar un análisis de haplotipos, este estudio identificó cinco genes potenciales, a saber, (transportador de la proteína de unión a ATP), (desconocido), (proteína de la familia de repeticiones de anquirina), (proteína transportadora de aminoácidos transmembrana) y (desconocido). Se requieren más estudios para confirmar la participación de los genes potenciales en la reacción a la bentazona comparando sus niveles de expresión entre plantas tolerantes y sensibles a la bentazona. Por lo tanto, los resultados de este estudio pueden ser utilizados para la selección asistida por marcadores en programas para la cría de soja tolerante a herbicidas.