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Análisis a nivel del genoma de la familia de genes de modificación de histonas () y estudio de la expresión durante el desarrollo de los anteras en arroz (L.)

Autores: Huang, Yongxiang; Liu, Jiawei; Cheng, Long; Xu, Duo; Liu, Sijia; Hu, Hanqiao; Ling, Yu; Yang, Rongchao; Zhang, Yueqin

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico
2024

Análisis a nivel del genoma de la familia de genes de modificación de histonas () y estudio de la expresión durante el desarrollo de los anteras en arroz (L.)


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Modificación de histonas
Familia de genes
Desarrollo de plantas
Respuestas al estrés
Eventos de duplicación de genes
Análisis del transcriptoma

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 10

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La modificación de histonas juega un papel crucial en la remodelación de la cromatina y en la regulación de la expresión génica, y participa en varios procesos biológicos, incluyendo el desarrollo de las plantas y las respuestas al estrés. Se han reportado varias familias de genes relacionadas con la modificación de histonas en diversas especies de plantas. Sin embargo, la identificación de miembros y sus funciones en la familia de genes de arroz (L.) a nivel del genoma completo sigue siendo poco clara. En este estudio, se identificaron un total de 130 a través de un análisis a nivel del genoma. La familia de genes se puede clasificar en 11 subfamilias basadas en un análisis filogenético. Un análisis de las estructuras de los genes y de los motivos conservados indica que los miembros de cada subfamilia comparten estructuras proteicas conservadas específicas, lo que sugiere sus posibles funciones conservadas. El análisis evolutivo molecular revela que un número significativo de proteínas se originó a partir de eventos de duplicación de genes, particularmente duplicaciones segmentarias. Además, el análisis del transcriptoma demuestra que se expresan ampliamente en varios tejidos de arroz y son sensibles a múltiples estreses abióticos. Catorce exhiben alta expresión en los anteras de arroz y alcanzan su punto máximo en diferentes etapas del desarrollo del polen. Los resultados de RT-qPCR aclaran aún más los patrones de expresión de estos 14 durante diferentes etapas de desarrollo de las anteras, destacando su alta expresión durante las etapas de meiosis y tetrada, así como en la etapa tardía del desarrollo del polen. Notablemente, se identificaron además como localizados en el núcleo. Este estudio proporciona un marco fundamental para explorar más a fondo las funciones de los genes en las plantas, particularmente para investigar sus funciones y aplicaciones potenciales en el desarrollo de las anteras de arroz y la esterilidad masculina.

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