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Análisis del genoma completo de la familia de genes de extrusión de compuestos multidrogas y tóxicos en la planta de té

Autores: Xie, Tao; Qian, Yumei; Wang, Deyan; Yan, Xiadong; Jiang, Ying; Li, Min; Rong, Hao; Xia, Tao

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico
2024

Análisis del genoma completo de la familia de genes de extrusión de compuestos multidrogas y tóxicos en la planta de té


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Agronomía y Ciencia de los Cultivos

Palabras clave

Análisis evolutivo
Estrés abiótico
Planta de té

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 21

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La familia de extrusión de compuestos multidroga y tóxicos (MATE) es la última clase de nuevos transportadores secundarios descubiertos en plantas. Sin embargo, actualmente no hay un análisis exhaustivo de la familia de genes en la planta de té. En este estudio, se identificaron 68 genes del genoma de la planta de té utilizando métodos bioinformáticos. En general, analizamos las relaciones evolutivas, la estructura de intrones-exones, la distribución en cromosomas, los dominios conservados y los patrones de expresión génica en diferentes tejidos y situaciones de estrés de la familia de genes. Los 68 CsMATEs se dividieron filogenéticamente en cuatro grandes grupos (Clase I a Clase IV). Los genes dentro de la misma clase presentan características estructurales similares, aunque muestran ciertas distinciones entre diferentes clases. El análisis evolutivo indicó que la familia de genes se expandió principalmente a través de eventos de duplicación génica, además de la duplicación próxima. A través del análisis de elementos -actuantes, se encontró que los genes pueden estar involucrados en el crecimiento, desarrollo y respuesta al estrés. Además, observamos que ciertos genes podrían ser inducidos a presentar expresión bajo condiciones de estrés abiótico como baja temperatura, alta salinidad (NaCl), estrés osmótico (PEG) y tratamiento con metil jasmonato (MeJA). Los hallazgos presentados aquí ofrecen una base teórica crucial para dilucidar las funciones biológicas de los genes, particularmente en respuesta al estrés abiótico, y proporcionan valiosos recursos genéticos potenciales para la cría de resistencia de la planta de té.

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