Estudios de Asociación del Genoma Completo sobre la Heterosis de Rasgos de Crecimiento en Conejos de Carne Híbridos
Autores: Xiao, Zhanjun; Li, Yuchao; Yang, Li; Cui, Mingyan; Wang, Zicheng; Sun, Wenqiang; Wang, Jie; Chen, Shiyi; Lai, Songjia; Jia, Xianbo
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Estudios de Asociación del Genoma Completo sobre la Heterosis de Rasgos de Crecimiento en Conejos de Carne Híbridos
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Aplicación
Heterosis
Ganado
Estudios de asociación a nivel del genoma
Genes candidatos
Regiones ROH
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
La aplicación de la heterosis no solo puede mejorar eficazmente la resistencia a enfermedades y la calidad de la carne del ganado, sino que también puede aumentar significativamente la reproducción y el crecimiento del ganado y las aves de corral. Realizamos estudios de asociación a nivel genómico utilizando datos de conejos de carne cruzados F2 para seleccionar genes candidatos con efectos dominantes significativos asociados con la variación de rasgos económicos. Se utilizó tecnología de secuenciación de alto rendimiento para obtener SNPs que cubren todo el genoma para evaluar la homocigosis del genoma de la población y analizar el número, la longitud, la frecuencia y la distribución de los ROHs en la población. Se buscaron genes candidatos relacionados con rasgos económicos de los conejos de carne basándose en regiones de ROH de alta frecuencia. Después del filtrado de control de calidad de los datos de genotipo, se identificaron 380 conejos cruzados F2 con 78,579 SNPs y 42,018 ROHs en los autosomas. El ajuste del modelo de curva de crecimiento logístico mostró que los conejos de 49 días eran un punto de inflexión en el crecimiento. Luego, a través de estudios de asociación a nivel genómico, se encontraron 10 loci SNP y siete genes candidatos de rasgos de crecimiento que estaban significativamente relacionados con el peso corporal en conejos de carne a los 84 días de edad. Además, revelamos los roles funcionales y las ubicaciones de 20 genes candidatos en la región de ROH de alta frecuencia asociada con rasgos económicos en conejos de carne. Este estudio identificó genes potenciales asociados con el crecimiento y desarrollo en la región de ROH de alta frecuencia de los conejos de carne. En este estudio, los genes candidatos identificados pueden ser utilizados como marcadores moleculares para la selección asistida en conejos de carne. Al mismo tiempo, la situación de endogamia basada en la evaluación de ROH puede proporcionar referencia para la cría y conservación de conejos de carne.
Descripción
La aplicación de la heterosis no solo puede mejorar eficazmente la resistencia a enfermedades y la calidad de la carne del ganado, sino que también puede aumentar significativamente la reproducción y el crecimiento del ganado y las aves de corral. Realizamos estudios de asociación a nivel genómico utilizando datos de conejos de carne cruzados F2 para seleccionar genes candidatos con efectos dominantes significativos asociados con la variación de rasgos económicos. Se utilizó tecnología de secuenciación de alto rendimiento para obtener SNPs que cubren todo el genoma para evaluar la homocigosis del genoma de la población y analizar el número, la longitud, la frecuencia y la distribución de los ROHs en la población. Se buscaron genes candidatos relacionados con rasgos económicos de los conejos de carne basándose en regiones de ROH de alta frecuencia. Después del filtrado de control de calidad de los datos de genotipo, se identificaron 380 conejos cruzados F2 con 78,579 SNPs y 42,018 ROHs en los autosomas. El ajuste del modelo de curva de crecimiento logístico mostró que los conejos de 49 días eran un punto de inflexión en el crecimiento. Luego, a través de estudios de asociación a nivel genómico, se encontraron 10 loci SNP y siete genes candidatos de rasgos de crecimiento que estaban significativamente relacionados con el peso corporal en conejos de carne a los 84 días de edad. Además, revelamos los roles funcionales y las ubicaciones de 20 genes candidatos en la región de ROH de alta frecuencia asociada con rasgos económicos en conejos de carne. Este estudio identificó genes potenciales asociados con el crecimiento y desarrollo en la región de ROH de alta frecuencia de los conejos de carne. En este estudio, los genes candidatos identificados pueden ser utilizados como marcadores moleculares para la selección asistida en conejos de carne. Al mismo tiempo, la situación de endogamia basada en la evaluación de ROH puede proporcionar referencia para la cría y conservación de conejos de carne.