es una especie rara de Coffea que cuenta con un perfil de sabor comparable al café Arábica y tiene una buena adaptabilidad a climas tropicales de tierras bajas. Esta especie enfrenta amenazas crecientes debido al cambio climático, la deforestación y la fragmentación del hábitat en su tierra natal de África Occidental. Utilizando 1037 nuevos marcadores SNP derivados de Genotipado por Secuenciación (GBS), revelamos la presencia de tres poblaciones naturales distintas (Fst medio = 0.176) en Sierra Leona. Se encontró evidencia de cuellos de botella recientes y un tamaño efectivo de población pequeño (118-140) en las tres poblaciones, reflejando el impacto de las recientes perturbaciones antropogénicas en esta especie. Usando un enfoque de inferencia flexible al modelo, desvelamos un fuerte cuello de botella antiguo hace aproximadamente 23,000 años, coincidiendo con el último máximo glacial (LGM), seguido de una expansión y divergencia postglacial en clústeres genéticos distintos. Un análisis comparativo entre bancos de genes ex situ y poblaciones naturales detectó una brecha significativa en la diversidad genética, con dos de las tres poblaciones naturales ausentes de la colección del banco de genes ex situ. Estos hallazgos destacan la urgente necesidad de mejorar las prácticas de conservación en Sierra Leona. Los nuevos marcadores SNP desarrollados en este estudio proporcionaron herramientas valiosas para apoyar futuros esfuerzos en la conservación y utilización de recursos genéticos en África Occidental.