Estudio de Asociación del Genoma Completo para Rasgos Esqueléticos Somáticos en Cerdos Duroc x (Landrace x Yorkshire)
Autores: Gao, Xin; Zhou, Shenping; Liu, Zhihong; Ruan, Donglin; Wu, Jie; Quan, Jianping; Zheng, Enqin; Yang, Jie; Cai, Gengyuan; Wu, Zhenfang; Yang, Ming
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Estudio de Asociación del Genoma Completo para Rasgos Esqueléticos Somáticos en Cerdos Duroc x (Landrace x Yorkshire)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Peso de hueso de cerdo
Investigación genética
Estudios de asociación a nivel del genoma
Polimorfismos de un solo nucleótido
Genes candidatos
Mejora genética
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
El rasgo de peso del hueso del cerdo tiene una importancia económica significativa en el sur de China. Para acelerar la selección del rasgo de peso del hueso del cerdo en la cría de cerdos, realizamos una investigación genética molecular sobre estos rasgos específicos. Estos rasgos abarcan el peso del hueso de la escápula (SW), el peso del hueso de la pata delantera (incluyendo húmero y cúbito) (FLBW), el peso del hueso de la pata trasera (incluyendo fémur y tibia) (HLBW) y el peso del hueso de la columna vertebral (SBW). Hasta ahora, la estructura genética relacionada con estos rasgos no ha sido explorada a fondo, principalmente debido a los desafíos asociados con la obtención de datos fenotípicos. En este estudio, utilizamos estudios de asociación del genoma completo (GWAS) para discernir polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) y genes asociados con cuatro rasgos de peso óseo dentro de una población compuesta por 571 cerdos híbridos Duroc x (Landrace x Yorkshire) (DLY). En los análisis, empleamos un modelo lineal mixto, y para la corrección de pruebas múltiples, se utilizaron tanto la tasa de descubrimiento falso como los métodos de Bonferroni. Tras la anotación funcional, se identificaron genes candidatos en función de su proximidad a los sitios candidatos y su asociación con los rasgos de peso óseo. Este estudio representa la aplicación inaugural de GWAS para la identificación de SNPs asociados con el peso óseo individual en cerdos DLY. Nuestro análisis reveló 26 SNPs e identificó 12 genes candidatos prometedores asociados con los cuatro rasgos de peso óseo. Además, nuestros hallazgos sobre los mecanismos genéticos que influyen en el peso óseo del cerdo ofrecen valiosos conocimientos como referencia para la mejora genética de los rasgos óseos del cerdo.
Descripción
El rasgo de peso del hueso del cerdo tiene una importancia económica significativa en el sur de China. Para acelerar la selección del rasgo de peso del hueso del cerdo en la cría de cerdos, realizamos una investigación genética molecular sobre estos rasgos específicos. Estos rasgos abarcan el peso del hueso de la escápula (SW), el peso del hueso de la pata delantera (incluyendo húmero y cúbito) (FLBW), el peso del hueso de la pata trasera (incluyendo fémur y tibia) (HLBW) y el peso del hueso de la columna vertebral (SBW). Hasta ahora, la estructura genética relacionada con estos rasgos no ha sido explorada a fondo, principalmente debido a los desafíos asociados con la obtención de datos fenotípicos. En este estudio, utilizamos estudios de asociación del genoma completo (GWAS) para discernir polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) y genes asociados con cuatro rasgos de peso óseo dentro de una población compuesta por 571 cerdos híbridos Duroc x (Landrace x Yorkshire) (DLY). En los análisis, empleamos un modelo lineal mixto, y para la corrección de pruebas múltiples, se utilizaron tanto la tasa de descubrimiento falso como los métodos de Bonferroni. Tras la anotación funcional, se identificaron genes candidatos en función de su proximidad a los sitios candidatos y su asociación con los rasgos de peso óseo. Este estudio representa la aplicación inaugural de GWAS para la identificación de SNPs asociados con el peso óseo individual en cerdos DLY. Nuestro análisis reveló 26 SNPs e identificó 12 genes candidatos prometedores asociados con los cuatro rasgos de peso óseo. Además, nuestros hallazgos sobre los mecanismos genéticos que influyen en el peso óseo del cerdo ofrecen valiosos conocimientos como referencia para la mejora genética de los rasgos óseos del cerdo.