La comprensión de los mecanismos moleculares involucrados en la adaptación a dietas alternas se ha convertido en una preocupación significativa, ya que cantidades crecientes de proteína de harina de pescado (FM) en los piensos acuáticos están siendo sustituidas por proteína vegetal. Así, el objetivo de este estudio fue evaluar el rendimiento de crecimiento, la calidad y la función hepática de juveniles a través de índices de crecimiento, composición corporal total, histología del hígado y secuenciación de ARN (RNA-seq), después de que fueron alimentados con una dieta formulada con un 64% de harina de semilla de algodón de bajo gossypol (LCSM) durante 56 días, en comparación con aquellos alimentados con una dieta tradicional basada en FM. Los indicadores de crecimiento, incluyendo el peso corporal final (FBW), la tasa de ganancia de peso (WGR), la tasa de crecimiento específica (SGR), el índice de eficiencia proteica (PER) y el factor de condición (CF), fueron considerablemente más bajos en el grupo de 64% LCSM (R64) que en el grupo de dieta FM. En la dieta R64, el lípido crudo total fue significativamente más bajo que en la dieta FM. La sección de hematoxilina-eosina mostró que niveles altos de LCSM en la dieta resultaron en vacuolación lipídica difusa en el hígado de . Según un análisis del transcriptoma hepático, la alta ingesta de LCSM en la dieta impactó significativamente la síntesis y el catabolismo de lípidos, elevó las vías para la síntesis de colesterol, bloqueó varias vías metabólicas de aminoácidos y afectó negativamente la gluconeogénesis y la glucólisis hepáticas. Los hallazgos de este estudio indican que alimentar con altos niveles de LCSM en es perjudicial para el crecimiento del organismo y puede dañar la integridad estructural del hígado, así como obstruir el metabolismo normal de aminoácidos, lípidos y carbohidratos. Por lo tanto, no se recomienda sustituir LCSM por altos niveles de FM en la dieta de .