Elucidando mecanismos genéticos de tolerancia al estrés de verano en repollo chino a través de GWAS y análisis fenotípico
Autores: Kim, Jinhee; Lee, Junho; Jang, Yoonah; Lee, Sangdeok; Lee, Woo-Moon; Wi, Seunghwan; Lee, Hyejin; Seo, Tae Cheol; Kim, Taebok; Yoon, Hyo In
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Elucidando mecanismos genéticos de tolerancia al estrés de verano en repollo chino a través de GWAS y análisis fenotípico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Desarrollo
Col china
Tolerante al estrés
Cambio climático
Estudio de asociación a nivel genómico
Genes candidatos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 25
Citaciones: Sin citaciones
El desarrollo de variedades de repollo chino (subsp. pekinensis) resistentes al cambio climático se está volviendo cada vez más crítico. Nuestro estudio se centró en el desarrollo de repollo chino tolerante al estrés durante la temporada de verano para minimizar los impactos del cambio climático global. Se evaluaron 52 accesiones de repollo chino cultivadas en el campo durante la temporada de primavera-verano en Corea. Se recopilaron diversos datos fenotípicos del repollo chino en ambientes adversos a partir de datos de campo. Además de la selección en campo, se utilizó una cámara de ambiente controlado para observar el impacto directo del calor en plantas jóvenes, especialmente en el área de la raíz. Se realizó un estudio de asociación a nivel genómico utilizando dos conjuntos de datos fenotípicos recopilados tanto de la cámara como de los estudios de campo y datos genotípicos adquiridos de análisis GBS. Se seleccionaron un total de 57 SNPs distribuidos en los 10 cromosomas que estaban altamente relacionados con los rasgos objetivo. Se anotaron varios genes candidatos utilizando las secuencias adyacentes de estos SNPs. El estudio reveló que la mayoría de los genes anotados parecían estar altamente relacionados con la función de la respuesta al estrés por calor. También se encontró que otros genes estaban relacionados con la respuesta al estrés ambiental y la floración. Estos SNPs y genes candidatos pueden proporcionar herramientas valiosas para que los criadores desarrollen variedades de repollo chino tolerantes al estrés del verano.
Descripción
El desarrollo de variedades de repollo chino (subsp. pekinensis) resistentes al cambio climático se está volviendo cada vez más crítico. Nuestro estudio se centró en el desarrollo de repollo chino tolerante al estrés durante la temporada de verano para minimizar los impactos del cambio climático global. Se evaluaron 52 accesiones de repollo chino cultivadas en el campo durante la temporada de primavera-verano en Corea. Se recopilaron diversos datos fenotípicos del repollo chino en ambientes adversos a partir de datos de campo. Además de la selección en campo, se utilizó una cámara de ambiente controlado para observar el impacto directo del calor en plantas jóvenes, especialmente en el área de la raíz. Se realizó un estudio de asociación a nivel genómico utilizando dos conjuntos de datos fenotípicos recopilados tanto de la cámara como de los estudios de campo y datos genotípicos adquiridos de análisis GBS. Se seleccionaron un total de 57 SNPs distribuidos en los 10 cromosomas que estaban altamente relacionados con los rasgos objetivo. Se anotaron varios genes candidatos utilizando las secuencias adyacentes de estos SNPs. El estudio reveló que la mayoría de los genes anotados parecían estar altamente relacionados con la función de la respuesta al estrés por calor. También se encontró que otros genes estaban relacionados con la respuesta al estrés ambiental y la floración. Estos SNPs y genes candidatos pueden proporcionar herramientas valiosas para que los criadores desarrollen variedades de repollo chino tolerantes al estrés del verano.