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Estudio de asociación de todo el genoma de rasgos relacionados con el rendimiento en una población de mapeo de asociación anidada cultivada en Kazajistán

Autores: Amalova, Akerke; Griffiths, Simon; Abugalieva, Saule; Turuspekov, Yerlan

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico
2024

Estudio de asociación de todo el genoma de rasgos relacionados con el rendimiento en una población de mapeo de asociación anidada cultivada en Kazajistán


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Agronomía y Ciencia de los Cultivos

Palabras clave

Estudio
Rasgos relacionados con el rendimiento
Líneas endogámicas recombinantes
Loci de caracteres cuantitativos
Estudio de asociación del genoma completo
Kazajistán

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 24

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Este estudio evaluó 290 líneas recombinantes endogámicas (RILs) de la población de Mapeo de Asociación Anidada (NAM) en el Reino Unido, que consta de 24 familias híbridas. Todos los genotipos fueron cultivados en el sureste de Kazajistán (Instituto de Investigación Agrícola y Cultivo de Plantas de Kazajistán, región de Almaty, 2021-2022) y en el norte de Kazajistán (Centro Científico de Producción de Granos Alexandr Barayev, región de Akmola, 2020). Los rasgos estudiados incluyeron seis características relacionadas con el rendimiento: longitud de la espiga (SL, cm), número de espigas productivas por planta (NPS, uds), número de granos por espiga (NKS, uds), peso de los granos por espiga (WKS, g), peso de mil granos (TKW, g) y rendimiento por metro cuadrado (YM2, g/m). Se observó una variabilidad fenotípica significativa entre los genotipos, lo que fue adecuado para el estudio de asociación a nivel genómico de rasgos relacionados con el rendimiento. El índice de Pearson mostró correlaciones positivas entre la mayoría de los rasgos relacionados con el rendimiento, aunque se encontró una correlación negativa entre NKS y TKW en las regiones del sureste, y no se registró correlación para las regiones del norte. Se identificaron líneas RILs con mejor rendimiento, superando a los controles locales, para NKS, TKW y YM2, lo que sugiere su potencial para programas de mejoramiento. La aplicación de GWAS permitió la identificación de 72 loci de rasgos cuantitativos (QTLs), incluidos 36 QTLs en la región del sureste, 16 QTLs en la región del norte y 19 en ambas ubicaciones. Once QTLs coincidieron con los informados en estudios anteriores de mapeo de QTL y GWAS para los rasgos estudiados. Los resultados pueden ser utilizados para estudios adicionales relacionados con la adaptación y productividad del trigo en proyectos de mejoramiento para una mayor productividad de grano.

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