Los rasgos de lactación son económicamente importantes para las vacas lecheras. El sur de China tiene un clima de alta temperatura y alta humedad, y las interacciones ambientales y genéticas impactan en gran medida el rendimiento del ganado lechero. El objetivo de este estudio fue identificar nuevos sitios de polimorfismo de un solo nucleótido y nuevos genes candidatos asociados con los rasgos de lactación en vacas Holstein chinas bajo condiciones de alta temperatura y humedad en el sur de China. Se realizó un estudio de asociación a nivel genómico para los rasgos de lactación de 392 vacas Holstein chinas, utilizando chips de genes SNP GGP Bovine 100 K. Se seleccionaron aproximadamente 23 loci polimórficos de nucleótidos únicos significativamente asociados con los rasgos de lactación. Entre ellos, 16 estaban asociados con la tasa de grasa de la leche, 7 con la tasa de proteína de la leche y 3 con el estrés por calor. Se identificó un locus de rasgo cuantitativo que afecta significativamente el porcentaje de grasa de la leche en vacas Holstein chinas dentro de una ventana de aproximadamente 0.5 Mb en la región de 0.4-0.9 Mb en el autosoma 14. Según los análisis de Gene Ontology y la Enciclopedia de Genes y Genomas de Kyoto, se identificaron diez genes asociados con el porcentaje de grasa de lactación, la producción de leche, la actividad antioxidante, la resistencia al estrés y la respuesta inflamatoria e inmune como candidatos clave para los rasgos de lactación. Los resultados de este estudio ayudarán en el desarrollo de un programa de selección y cría efectivo para las vacas Holstein chinas en regiones de alta temperatura y humedad.