Una investigación de las variaciones en los genomas mitocondriales completos en la región del Pacífico Occidental
Autores: Karagozlu, Mustafa Zafer; Do, Thinh Dinh; Kim, Jung-Il; Choi, Tae-June; Kim, Seong-Geun; Kim, Chang-Bae
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Una investigación de las variaciones en los genomas mitocondriales completos en la región del Pacífico Occidental
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Braquiópodo
Región del Pacífico occidental
Variaciones genéticas
Genoma mitocondrial
Genes que codifican proteínas
Análisis filogenéticos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 24
Citaciones: Sin citaciones
es un braquiópodo ampliamente distribuido en la región del Pacífico occidental. A pesar de haber sido objeto de varios estudios biológicos, todavía hay información limitada sobre las variaciones genéticas intraespecíficas de . En este estudio, se recolectaron especímenes de Corea y Vietnam, y se analizaron y compararon las secuencias del genoma mitocondrial completo (mitogenoma) con registros anteriores. Los mitogenomas totales de fueron de 24,875 pb y 25,305 pb de tamaño para los especímenes coreanos y vietnamitas, respectivamente. Esos mitogenomas son extraordinariamente más largos que el tamaño típico del mitogenoma para un animal, pero más cortos que el registro anterior de Yanagawa (Japón) para esta especie. Los órdenes de los genes y los tamaños de los genes que codifican proteínas también son diferentes de los del espécimen japonés. Además, se calcularon las tasas de sustitución no sinónima (Ka) y sinónima (Ks) en los genes que codifican proteínas (PCGs) para probar la idea de diferencias en la tasa evolutiva en los genomas mitocondriales. Los análisis mostraron Ka y Ks relativamente bajos para los mitogenomas completos de Buan (Corea), Doson (Vietnam) y Yanagawa (Japón). La relación Ka/Ks fue inferior a 1 en las comparaciones de las tres localidades, lo que indica la existencia de selección purificadora en esta especie. Los análisis filogenéticos mostraron que divergieron entre localidades en la región del Pacífico occidental.
Descripción
es un braquiópodo ampliamente distribuido en la región del Pacífico occidental. A pesar de haber sido objeto de varios estudios biológicos, todavía hay información limitada sobre las variaciones genéticas intraespecíficas de . En este estudio, se recolectaron especímenes de Corea y Vietnam, y se analizaron y compararon las secuencias del genoma mitocondrial completo (mitogenoma) con registros anteriores. Los mitogenomas totales de fueron de 24,875 pb y 25,305 pb de tamaño para los especímenes coreanos y vietnamitas, respectivamente. Esos mitogenomas son extraordinariamente más largos que el tamaño típico del mitogenoma para un animal, pero más cortos que el registro anterior de Yanagawa (Japón) para esta especie. Los órdenes de los genes y los tamaños de los genes que codifican proteínas también son diferentes de los del espécimen japonés. Además, se calcularon las tasas de sustitución no sinónima (Ka) y sinónima (Ks) en los genes que codifican proteínas (PCGs) para probar la idea de diferencias en la tasa evolutiva en los genomas mitocondriales. Los análisis mostraron Ka y Ks relativamente bajos para los mitogenomas completos de Buan (Corea), Doson (Vietnam) y Yanagawa (Japón). La relación Ka/Ks fue inferior a 1 en las comparaciones de las tres localidades, lo que indica la existencia de selección purificadora en esta especie. Los análisis filogenéticos mostraron que divergieron entre localidades en la región del Pacífico occidental.