Novela Base de Heredabilidad del Fenotipo de Cuatro Cuernos en Ovejas Usando Datos de Secuenciación de Genoma Completo
Autores: Zhang, Haoyuan; Yang, Pu; Liu, Chengli; Ma, Yuehui; Han, Yanguo; Zeng, Yan; Huang, Yongfu; Zhao, Yongju; Zhao, Zhongquan; He, Xiaohong; E, Guangxin
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Novela Base de Heredabilidad del Fenotipo de Cuatro Cuernos en Ovejas Usando Datos de Secuenciación de Genoma Completo
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Zootecnia
Palabras clave
Importante
Base genética
Estudio de asociación a nivel genómico
Fenotipo
Genes candidatos
Genes reguladores
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
Los cuernos son un rasgo reproductivo importante para las ovejas. Sin embargo, no hay un punto de vista ampliamente reconocido sobre los genes reguladores y los mecanismos de los cuernos, y la base genética del fenotipo de cuatro cuernos (FHP) no está clara. Este trabajo realizó un estudio de asociación a nivel genómico con 100 genomas de ovejas de múltiples razas para investigar la base genética del FHP. Los resultados revelaron tres asociaciones significativas (corregidas como < 1.64 x 10) de los InDels (CHR2: g.133,742,709delA, g.133,743,215insC y g.133,743,940delT) para el FHP en la secuencia intergénica (IGS) entre el y el de CHR2. Además, se identificaron 14 asociaciones significativas (corregidas como < 1.42 x 10) de SNPs con el fenotipo FHP en CHR2 y CHR16, incluyendo cinco (por ejemplo, CHR16: g.40,351,378G > A y g.40,352,577G > A) ubicados en el intrón del gen, ocho (por ejemplo, CHR2: g.133,727,513C > T y g.133,732,145T > G) en el IGS entre y , y solo uno (CHR2: g.133,930,761A > G) en el IGS entre y . También se observó una divergencia obvia en los patrones de genotipo entre el FHP y otros (dos cuernos y sin cuernos) en las regiones de los y genes. También ocurrió un enlace extremadamente significativo entre los Loci I y Loci II dentro de 100 individuos (LD = -156.02186, < 0.00001). En resumen, nuestro estudio indicó que las secuencias genómicas de CHR2 y CHR16 contribuyeron al FHP en las ovejas, específicamente los genes candidatos clave y . Estos resultados mejoraron nuestra comprensión de la base genética mendeliana del FHP en las ovejas.
Descripción
Los cuernos son un rasgo reproductivo importante para las ovejas. Sin embargo, no hay un punto de vista ampliamente reconocido sobre los genes reguladores y los mecanismos de los cuernos, y la base genética del fenotipo de cuatro cuernos (FHP) no está clara. Este trabajo realizó un estudio de asociación a nivel genómico con 100 genomas de ovejas de múltiples razas para investigar la base genética del FHP. Los resultados revelaron tres asociaciones significativas (corregidas como < 1.64 x 10) de los InDels (CHR2: g.133,742,709delA, g.133,743,215insC y g.133,743,940delT) para el FHP en la secuencia intergénica (IGS) entre el y el de CHR2. Además, se identificaron 14 asociaciones significativas (corregidas como < 1.42 x 10) de SNPs con el fenotipo FHP en CHR2 y CHR16, incluyendo cinco (por ejemplo, CHR16: g.40,351,378G > A y g.40,352,577G > A) ubicados en el intrón del gen, ocho (por ejemplo, CHR2: g.133,727,513C > T y g.133,732,145T > G) en el IGS entre y , y solo uno (CHR2: g.133,930,761A > G) en el IGS entre y . También se observó una divergencia obvia en los patrones de genotipo entre el FHP y otros (dos cuernos y sin cuernos) en las regiones de los y genes. También ocurrió un enlace extremadamente significativo entre los Loci I y Loci II dentro de 100 individuos (LD = -156.02186, < 0.00001). En resumen, nuestro estudio indicó que las secuencias genómicas de CHR2 y CHR16 contribuyeron al FHP en las ovejas, específicamente los genes candidatos clave y . Estos resultados mejoraron nuestra comprensión de la base genética mendeliana del FHP en las ovejas.