Los rasgos de arquitectura de la planta están estrechamente relacionados con la biomasa de la planta, el encamado y la eficiencia fotosintética, que a su vez afectan el rendimiento de la soja. En este estudio, investigamos una colección nuclear de soja china que consta de 224 accesiones de germoplasma para cuatro rasgos relacionados con la arquitectura de la planta (altura de la planta (PH), número de nudos en el tallo principal (NN), número de ramas (BN) y diámetro del tallo (DI)) en tres ambientes y realizamos un estudio de asociación a nivel genómico (GWAS) basado en 1514 polimorfismos de nucleótido único (SNPs). Se encontraron un total de 41 SNPs asociados significativamente con PH, NN, BN y DI en dos o más ambientes. Entre estos SNPs, 15 estaban ubicados en regiones en las que se habían reportado QTLs relacionados con la arquitectura de la planta en estudios anteriores, y 26 eran nuevos loci genéticos. Además, se obtuvieron 18 genes candidatos potenciales para rasgos relacionados con la arquitectura de la planta al predecir los genes en el intervalo de cuatro marcadores de gran efecto (BARC-017097-02199, Map-2213, BARC-014639-01604 y Map-2223). Esta investigación ayudará a iluminar la base genética de los rasgos relacionados con la arquitectura de la planta de soja y acelerar el proceso de mejoramiento de la arquitectura de la planta mediante la selección asistida por marcadores moleculares en la soja.