El desarrollo de eucariotas multicelulares, según su plan corporal, a menudo está dirigido por miembros de familias multigénicas que codifican factores de transcripción. Los genes de caja MADS (por MINICHROMOSOME MAINTENANCE1, AGAMOUS, DEFICIENS y SERUM RESPONSE FACTOR) forman una de esas familias que controlan casi todos los aspectos principales del desarrollo de las plantas. Conocer el complemento completo de genes de caja MADS en genomas de plantas secuenciados permitirá una mejor comprensión de los patrones evolutivos de estos genes y la asociación de su evolución con la evolución de las morfologías de las plantas. Aquí, hemos aplicado una combinación de anotaciones automáticas y manuales para identificar el conjunto completo de genes de caja MADS en 17 genomas de plantas. Además, se reanalizaron tres genomas de plantas y se utilizaron conjuntos de datos publicados para cuatro genomas, de modo que más de 2,600 genes de 24 especies fueron clasificados en los dos tipos de genes de caja MADS, Tipo I y Tipo II. Nuestros resultados amplían estudios previos, destacando los patrones evolutivos notablemente diferentes de los genes Tipo I y Tipo II y proporcionan una base para estudios adicionales sobre la evolución y función de los genes de caja MADS.