Para investigar los efectos de la espermidina exógena (Spd) en los cambios metabólicos bajo estrés salino en las raíces de pepino, se realizó una cromatografía de gases-espectrometría de masas (GC-MS). Los resultados mostraron que la mayoría de los 142 metabolitos respondieron al estrés salino o al tratamiento con Spd exógeno. El estrés salino redujo el consumo de carbono, resultó en la transformación de la glucólisis y el ciclo del ácido tricarboxílico (TCA) hacia la vía de la pentosa fosfato (PPP), y al mismo tiempo aumentó la síntesis de ácido salicílico (SA) y etileno, y, por lo tanto, inhibió el crecimiento de plántulas. Sin embargo, la Spd exógena mejoró aún más la utilización de carbono, el patrón de ahorro de energía de la acumulación de aminoácidos y el control de los radicales hidroxilo. En conclusión, la Spd podría promover el metabolismo energético e inhibir la síntesis de SA y etileno en favor del crecimiento de las raíces que contribuye a una mayor tolerancia salina. Este estudio proporciona información que podría facilitar una mejor comprensión de la resistencia a la sal por parte de la Spd en las plántulas de pepino.