La leptospirosis es una zoonosis que afecta a humanos y animales en todo el mundo. Los mapaches, adoptados en entornos urbanos, pueden actuar como reservorios potenciales. Investigamos la prevalencia de patógenos en las muestras de riñón y orina de mapaches que viven en Tokio, así como los anticuerpos anti-leptospirales en su suero, y nuestro objetivo fue examinar los factores que exponen a los mapaches a la leptospirosis. Se utilizaron la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y el ensayo por inmunoadsorción enzimática (ELISA) para detectar el ADN leptospiral y los anticuerpos anti-leptospirales, respectivamente. Treinta y seis de 156 mapaches (23.1%) fueron positivos por PCR, y 16 de 165 mapaches (9.7%) fueron positivos por ELISA. Las tasas de prevalencia y seroprevalencia diferían según el período de dispersión de los mapaches. Utilizamos regresión logística univariable para estimar los factores ambientales asociados con los patógenos y los anticuerpos anti-leptospirales en los mapaches. Se observaron diferencias significativas en los resultados de PCR para las estaciones (primavera-verano) (p = 0.01), la temperatura media mensual (p < 0.01) y la precipitación media mensual (p < 0.01). No se observó una diferencia significativa en los resultados de ELISA, pero los mapaches en áreas urbanas más grandes tendían a tener tasas de seroprevalencia más altas (p = 0.06). Identificamos un patrón de propagación leptospiral en la dispersión de mapaches y factores ambientales que exponen a los mapaches a la leptospirosis.