Los paisajes rurales europeos contienen tierras agrícolas de alto valor natural que, además de ser la principal actividad económica en muchas áreas rurales, albergan hábitats y especies de gran valor de conservación. El mantenimiento de estos sistemas agrícolas depende en gran medida del conocimiento ecológico tradicional y de los estilos de vida rurales de las poblaciones locales. Sin embargo, no han sido suficientemente apreciados y protegidos, y como resultado, actualmente están amenazados. En este estudio, que se realizó en la región de Madrid (España central), analizamos los cambios socioecológicos del paisaje rural tras el establecimiento de una red de áreas naturales protegidas. Los resultados obtenidos destacan una pérdida significativa de estos sistemas agrícolas de alto valor natural y un marcado aumento de los procesos de rewilding caracterizados por la transición de matorral a bosque y el desarrollo de sistemas forestales. Estos procesos están vinculados a la interrupción de la transmisión del conocimiento ecológico tradicional, lo que puede implicar consecuencias negativas tanto para la alta diversidad biocultural que albergan estos sistemas como para la identidad cultural y la socioeconomía de las poblaciones rurales que allí viven. Se proporciona una herramienta metodológica útil para la planificación social-ecológica del territorio y el diseño de estrategias de gestión efectivas para la conservación de los paisajes culturales rurales.