Los objetivos de este trabajo fueron (a) describir el riesgo de incidencia de mastitis subclínica en rebaños lecheros a lo largo del período de ordeño, (b) presentar asociaciones potenciales de la mastitis subclínica con la calidad de la leche y (c) identificar factores de riesgo para un alto riesgo de incidencia de la infección. Se realizó un estudio longitudinal en 12 rebaños de ovejas lecheras en Grecia. Se recolectaron muestras de secreción mamaria de 240 ovejas y muestras de leche de tanque en cuatro visitas repetidas durante un período de seis meses para exámenes bacteriológicos, químicos y citológicos. En general, el riesgo de incidencia de mastitis subclínica durante el período del estudio fue del 51.7%, y varió entre las granjas del 25.0% al 75.0%. La cifra respectiva para la mastitis subclínica estafilocócica fue del 48.8%. El riesgo de incidencia de recurrencia de mastitis subclínica entre las ovejas en los rebaños fue del 35.4%. Las bacterias identificadas con mayor frecuencia en los casos de mastitis subclínica fueron ; de los aislados estafilocócicos que causan mastitis, el 65.4% formaban biopelículas. Los recuentos de células somáticas en la leche de tanque aumentaron progresivamente a medida que avanzaba el período de lactancia, con aumentos significativos observados en la tercera y cuarta visita a las granjas. Los recuentos de células somáticas en la leche de tanque se correlacionaron bien con la prevalencia de mastitis subclínica en los rebaños. Se observó una correlación inversa significativa y una correlación positiva significativa para la prevalencia de mastitis subclínica frente al contenido total de proteínas o agua añadida en la leche de tanque. Durante el análisis multivariable, la menor edad de los recién nacidos al ser separados de la madre y, en consecuencia, el inicio retrasado del ordeño de las ovejas, la omisión de la vacunación anti-mastitis de las ovejas y la falta de personal empleado en las granjas resultaron estar significativamente asociados (positivamente) con un aumento del riesgo de incidencia de mastitis subclínica.