La enfermedad inflamatoria intestinal (EII) es una enfermedad crónica caracterizada por diferentes infiltrados celulares en el intestino. Los objetivos de este estudio fueron reportar los hallazgos clínicos y clinicopatológicos en caballos con cambios histológicos compatibles con EII en el duodeno. Además, se investigó la progresión clínica de la EII y la supervivencia. Se revisaron los registros de pacientes de caballos en los que se encontró evidencia histológica de EII en biopsias duodenales recolectadas durante la endoscopia. Los cambios histológicos se clasificaron como leves, moderados o severos y se registró el tipo de célula infiltrante predominante. La mejora clínica fue evaluada por el propietario a través de un cuestionario a las 6 semanas después de la biopsia, junto con la supervivencia después de un año. En total, se incluyeron 149 caballos, y los signos clínicos más comunes fueron pérdida de peso, reducción del rendimiento y dolor durante la palpación abdominal. La mayoría de los caballos mostraron malabsorción parcial durante una prueba de absorción de glucosa oral, y los caballos con EII severa tenían concentraciones de proteínas séricas más bajas. La enteritis linfoplasmocítica fue el tipo más común de EII (78.5% de los casos), mientras que en seis caballos se presentó infiltración neutrofílica del duodeno. En general, el 71% de los casos mejoraron clínicamente después de seis semanas, principalmente tras el tratamiento con corticosteroides. Los resultados de una segunda biopsia fueron un mal predictor de mejora, y los caballos que mejoraron después de 6 semanas tenían más probabilidades de estar vivos después de un año.