La aglomeración urbana en los tramos medios del río Yangtsé ocupa una posición estratégica crucial en el panorama del desarrollo económico y social de China. Explorar los efectos del desarrollo coordinado dentro de la economía digital y la innovación en esta área es propicio para promover el desarrollo de la región central de China y del Cinturón Económico del Yangtsé. Este documento utiliza las 28 ciudades de muestra en la aglomeración urbana de los tramos medios del río Yangtsé como muestra de estudio, y construye un sistema de indicadores de economía digital y un sistema de indicadores de eficiencia de innovación urbana. Basado en el modelo de grado de coordinación de acoplamiento, utilizamos estimación de densidad kernel, el algoritmo de cadena de Markov y el método de descomposición del coeficiente de Gini de Dagum para investigar empíricamente las tendencias dinámicas en el desarrollo de la coordinación de acoplamiento entre la economía digital y la eficiencia de innovación urbana desde 2012 hasta 2021. Los resultados de la investigación revelan una tendencia general ascendente en la economía digital, la eficiencia de innovación y las etapas de desarrollo de coordinación de acoplamiento. Sin embargo, la tendencia ascendente va acompañada del riesgo de recesión. Además, hay diferencias significativas entre las ciudades, como lo destacan las diferencias entre Wuhan y otras ciudades. A la luz de los hallazgos, se recomienda que los departamentos gubernamentales tomen medidas, incluyendo estar alerta al riesgo de desarrollo regresivo, desarrollar las ciudades de manera realista y aprovechar las experiencias de ciudades destacadas en desarrollo. Esta investigación puede proporcionar nuevas perspectivas y referencias empíricas para que las entidades gubernamentales tomen medidas para un desarrollo más coordinado de la economía digital y la eficiencia de innovación en la aglomeración urbana de los tramos medios del río Yangtsé.